內容簡介
《華大基因國傢基因庫係列:生物信息數據庫建設、使用與管理指南》先從整體上對國內外生物信息數據庫進行整體的概述。從數據來源、數據類型、生物數據分析方法、生物信息分析平颱等方麵探討如何對生物數據庫的數據進行管理,包括數據采集、數據存儲、備份和恢復等。然後介紹瞭數據庫設計的方法、原則及常見生物信息數據庫的特點並以NCBI為例介紹瞭數據庫如何提交數據、檢索數據等。最後探討瞭數據庫的倫理學及知識産權保護問題。
目錄
前言第一篇 生物信息數據庫概述1 生物信息數據庫1.1 生物信息數據庫概述1.2 生物信息數據庫的分類2 國內外生物信息數據庫的發展2.1 國際生物信息數據庫的發展2.2 中國的生物信息數據庫建設2.3 建設生物信息數據庫:存在的問題和解決思路探討
第二篇 用於建立生物信息數據庫的數據管理3 數據來源3.1 從各種生物信息數據庫的FTP下載3.2 各種生物信息數據庫的查詢結果3.3 各實驗終端提供的數據4 數據類型4.1 原始數據4.2 生物信息分析數據5 生物信息分析平颱5.1 生物信息分析平颱簡介5.2 Galaxv平颱5.3 GenePattel—n生物分析平颱5.4 DNAnexus生物分析平颱5.5 Blast forneKP Project6 數據質量管理規範6.1 數據質量概述6.2 生物數據的質量控製7 數據存儲管理7.1 存儲內容7.2 大數據存儲7.3 存儲方式7.4 存儲管理一般原則8 數據備份和恢復管理規範8.1 數據的備份8.2 數據的恢復9 數據安全管理規範9.1 數據分類9.2 權限管理9.3 注意事項
第三篇 建立生物信息數據庫的實用指南10 概述10.1 引言10.2 數據相關的基本概念11 數據庫設計11.1 數據庫設計過程11.2 數據庫設計規範(以關係數據庫為例)11.3 數據庫命名規範12 常見生物信息數據庫特點12.1 數據模型12.2 數據庫的存儲13 生物信息數據庫係統開發13.1 虛擬本地數據庫13.2 本地數據庫
第四篇 生物信息數據庫的使用管理規範14 數據庫的安全性管理14.1 安全性的類型14.2 數據庫安全性控製方法14.3 基於角色訪問控製的安全性和權限管理15 數據提交管理15.1 概述15.2 提交內容15.3 提交方式16 數據共享和交互17 數據檢索17.1 檢索工具17.2 檢索結果格式j
第五篇 倫理學問題18 國際倫理法則19 生物大數據中的倫理問題20 國內生物信息數據庫中的倫理問題21 倫理規範21.1 倫理的原則21.2 關於知情同意22 倫理審查建設22.1 公開透明的政策和社會廣泛參與22.2 信息的處理(保密和告知研究結果)應以參與者利益為重22.3 建立有效的監督和責任機製22.4 加強倫理審查能力建設
第六篇 生物信息數據庫知識産權保護23 引言24 國內外數據庫權利保護相關條約、協議24.1 歐盟數據庫法律保護24.2 美國數據庫法律保護24.3 WIP0數據庫法律保護24.4 我國數據庫法律保護現狀25 生物信息數據庫的保護模式探討25.1 存在的問題25.2 生物信息數據庫知識産權保護建議
參考文獻縮略語錶名詞術語
前言/序言
華大基因國傢基因庫係列:生物信息數據庫建設、使用與管理指南 下載 mobi epub pdf txt 電子書 格式