蛋白质组学和代谢组学途径的生物标志物发现 [Proteomic and Metabolomic Approaches to Biomarker Discovery] 下载 mobi epub pdf 电子书 2024

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内容简介

　　生物标志物的发现对于疾病的早期诊断、治疗反应的监测，以及临床结果的预测等临床和医疗环境的多个领域具有重要的价值。如何在复杂的生物基质中发现有足够灵敏度和特异性的特定生物标志物，对分析技术提出了巨大挑战。HaleemJ.Issaq和TimothyD.Veenstra博士编写的《蛋白质组学和代谢组学途径的生物标志物发现》是对生物标志物发现技术的概述，主要介绍了基于蛋白质组学和代谢组学等“组学”技术开展的生物标志物发现研究，对整体实验设计、样品制备、分析技术和生物信息学分析的发展进行了全面系统的介绍，同时结合了生物标志物的验证过程以及在临床中的应用实例。
　　《蛋白质组学和代谢组学途径的生物标志物发现》可以作为发现和验证新生物标志物的工具书，为相关科研工作者、本科生和研究生，以及那些有兴趣寻找疾病生物标志物的读者提供指导。也可为生物标志物的应用提供帮助，使读者全面系统地了解国内外生物标志物的研究现状和发展趋势。

内页插图

目录

译者序
前言
作者名单

第1章 生物标志物的发现：实验设计和实施
1．1 引言
1．2 定义
1．3 生物标志物发现的现状
1．4 实验设计和实施
1．5 实验设计过程的差错
1．6 实验实施过程的误差
1．7 蛋白质生物标志物的特异性
1．8 数据统计分析
1．9 建议
1．1 0结论和展望
致谢
参考文献

第2章 基于蛋白质组学和质谱技术的生物标志物的发现
2．1 引言
2．2 蛋白质生物标志物的发现和发展原则
2．3 蛋白质组学样品制备
2．4 蛋白质的质谱鉴定
2．5 翻译后修饰疾病生物标志物
2．6 蛋白质的质谱定量分析
2．7 生物标志物的确认
2．8 生物标志物的验证
2．9 基于质谱的蛋白质生物标志物发现的局限性
2．10 结论和展望：整合的生物标志物发现平台
参考文献

第3章 蛋白质组学分析组织样本前处理方法
3．1 引言
3．2 基于质谱的蛋白质组学研究可使用的组织样本类型
3．3 组织样本裂解／均质化
3．4 萃取
3．5 结论
致谢
参考文献

第4章 代谢组学中生物体液和组织样本前处理技术
4．1 引言
4．2 代谢组学中理想的样本前处理技术
4．3 生物体液样本前处理方法
4．4 组织样本代谢组学
4．5 代谢组学中样本前处理新发展趋势
4．6 结论和展望
致谢
参考文献

第5章 血样样本采集：分析前变量和标准操作规程
5．1 引言
5．2 分析前变量的重要性
5．3 标准操作规程
5．4 样本选择原则
5．5 人血液样本及其成分
5．6 其他生物样本
5．7 血源性病原体，全面性防护措施和安全性
5．8 受试者保护
5．9 结论
参考文献

第6章 基于核磁共振的生物标志物发现方法
6．1 引言：为什么使用核磁共振？
6．2 核磁共振硬件进展
6．3 核磁共振分析的样品前处理
6．4 一维核磁共振方法：氢谱、碳谱和磷谱
……
第7章 在不分馏的情况下使用数据独立采集的质谱扩展检测动态范围
第8章 基于气相色谱／质谱的代谢组学研究
第9章 基于液相色谱／质谱的代谢组学研究
第10章 基于毛细管电泳／质谱的蛋白质组学和代谢组学研究
第11章 凝胶电泳法在低丰度蛋白标志物筛查中的应用进展
第12章 基于二维差异凝胶电泳途径的生物标志物发现
第13章 基于亲和定向实验的生物标志物发现
第14章 微波辅助天冬氨酸选择性蛋白酸水解
第15章 生物标志物发现的样本消耗、分级分离和富集
第16章 蛋白和代谢物的鉴定
第17章 疾病相关蛋白质生物标志物的定量蛋白质组学发展
第18章 基于质谱和核磁共振的定量代谢组学
第19章 代谢组学和蛋白质组学数据的多元分析
第20章 用于蛋白质分子诊断和生物标志物发现的自上而下的质谱技术
第21章 蛋白-蛋白交互网络在潜在生物标志物识别和表征中的作用
第22章 反相蛋白芯片技术：临床研究领域进展
第23章 自身抗体和生物标志物的发现
第24章 微小核糖核酸及生物标志物的发现
第25章 组织中完整生物分子的质谱成像
第26章 基于质谱的蛋白质生物标志物的确认方法
第27章 用于生物标志物发现的代谢物质谱数据处理
第28章 分析方法和生物标志物的验证
索引

前言/序言

　　寻找一个生物标志物就像是大海捞针，甚至犹有过之。有时在生物体液和组织中搜寻蛋白质或代谢生物标志物，其结果往往不是一个化合物，而是多个化合物。虽然过去十年间人们付出了很多努力，却仅有为数不多的生物标志物得以识别，且部分生物标志物的灵敏度和特异性还不能满足需要。这是由于有时样本不纯，采集、存储和识别也不太规范。此外，样本和对照的数量很少，且性别、年龄和种族不同。所使用的分析技术既没有经过优化，也没有制定或遵循标准操作规程。除了先进的设备以外，生物标志物的识别还需要医生、分析化学家、技术人员、病理学家和统计学家的参与。
　　伴随着高通量基因测序带来的数据快速增长，科学家转向蛋白质和代谢物检测只是一个时间问题。显然，蛋白质组学发展较早，目前也比代谢组学更成熟。然而，代谢组学在过去十年间也从蛋白质组学带来的巨大技术进步中受益。这些技术进步主要是在质谱（MS）和核磁共振谱（NMR）方面所取得的。从本书的相关主题可以看出，MS是同时推动蛋白质组学和代谢组学发展的主要技术。进行成功的蛋白质组学和代谢组学研究不仅仅要拥有最先进的MS或者NMR。本书的大部分章节聚焦于样品进入仪器分析之前发生了什么。样品制备仍然是蛋白质组学和代谢组学最活跃的研究领域之一。考虑到蛋白质组学和代谢组学研究分析的分子的多样性，样品制备领域的研究也是必要的。
　　在蛋白质组学中，目标分子化学性质的多样性可通过将完整的蛋白质水解成肽而最小化。虽然不是所有的肽都具有相同的物理化学性质，但其性质（体积、疏水性、等电点等）多样性仍比完整蛋白质小得多。不幸的是，目前还没有任何方法可以使生物体液和细胞中发现的全部代谢物的多样性最小化。鉴于在优化靶向分析试验中特定代谢物的提取、分离和仪器条件等方面所付出的努力，寻找可分析全代谢物组的最佳条件所面临的挑战是显而易见的。因此，样品制备和筛分复杂代谢物的方法已经变得越来越重要，本书中的若干章节将直接解决这个问题。
　　蛋白质组学和代谢组学样品制备、分析技术和生物信息学分析的发展对于发现特定的生物标志物至关重要。诚然，实现这一目标并不像十年前预测的那么容易；然而，过去十年间技术的发展使得我们离目标比以往任何时候都更接近。
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