內容簡介
本書匯總瞭具有多年生物學實驗室工作經驗的研究人員在蛋白質相互作用研究方麵的經驗和心得體會,同時注重吸收藉鑒瞭國際上相關領域最新的進展。
本書從蛋白質相互作用的基本理論開始,到各種經典的蛋白質相互作用的鑒定技術,再到生物信息學的應用,內容涵蓋瞭當前國際上蛋白質相互作用研究領域的各個方麵。書中每個章節的基本內容都包括:引言、原理、實驗材料、詳細步驟、結果分析(實例)、注意要點、疑難分析解答、參考文獻。本書編者力求做到深入淺齣,讓書稿對實驗具有實際指導意義。本書的齣版能對國內的研究人員在蛋白質功能研究方麵做齣有益的指導。
內頁插圖
目錄
第一部分 蛋白質相互作用概論
第一章 蛋白質與蛋白質相互作用的結構基礎
第二章 蛋白質相互作用的定量分析
第二部分 實驗方法
第三章 酵母雙雜交係統篩選和驗證蛋白質相互作用
第四章 細菌雙雜交技術
第五章 哺乳動物雙雜交
第六章 噬菌體展示技術
第七章 GST沉降實驗
第八章 免疫共沉澱(Co-IP)實驗
第九章 Far-Westem blotting實驗
第十章 蛋白質化學交聯
第十一章 串聯親和純化
第十二章 雙嚮凝膠電泳分析蛋白質復閤物
第十三章 用於質譜分析的凝膠分離相互作用蛋白質的樣品準備
第十四章 激光共聚焦技術在蛋白質亞細胞定位與蛋白質相互作用中的應用
第三部分 生物信息學在蛋白質相互作用研究中的應用
第十五章 利用計算生物學的方法進行全基因組水平的蛋白質相互作用分析
第十六章 蛋白質相互作用生物信息學檢索與預測
第十七章 常用互聯網蛋白相互作用數據庫資源的使用
精彩書摘
一、引言
隨著基因組學、蛋白質組學時代的到來以及對大分子的研究不斷深入,我們開始更深入地解釋和揭示生命的奧秘。研究人員可以通過實驗手段得到幾種類型蛋白質與蛋白質相互作用的結構模式,蛋白質晶體結構的研究錶明蛋白質相互作用存在著很大的復雜性和多變性。與此相襯,蛋白質結構解析的手段在某些方麵已經不能滿足要求,現在研究的發展需要對成批量的蛋白質,特彆是對蛋白質復閤體相互之間的作用模式進行結晶和結構的解析。以前,蛋白質復閤物的三維結構僅限於抗原抗體復閤物的結構,以及蛋白酶和抑製劑復閤物的晶體結構,對於在生物體內更復雜的信號分子傳導途徑中的蛋白質的相互作用以及它們的晶體結構則研究相對較少。隨著近年來研究的深入,對這方麵開始有一些初步的研究。目前,結構研究比較普遍的有兩類蛋白質復閤物,一類是結構域-結構域復閤物(domain-domain),即兩個預先摺疊好的結構域相互作用形成個復閤物;另一類是結構域-蛋白質復閤物(domain-protein),這類復閤物中的一個組分在遊離的狀態下是綫性分子。
人們關於蛋白質與蛋白質相互作用結構基礎的瞭解,一方麵來自通過實驗手段對這些復閤物晶體結構進行解析,明確其相互作用的結構基礎;另一方麵則來自於理論上的計算和推測,通過對多數蛋白質的疏水性、可接近的蛋白質錶麵大小、形狀以及氨基酸殘基特性等結構特點,對蛋白質復閤物組分的內部、錶麵和相互作用的界麵這些結構特徵進行分析總結,推論相互作用蛋白質錶麵的一些規律性的特徵,並試圖通過蛋白質的疏水性去推測它們相互作用的位點。
本章將從總體水乎上對蛋白質-蛋白質相互作用的結構基礎進行概括性的闡述,從結構上對其相互作用的機製進行探討。
前言/序言
在生物學研究的實踐過程中,人們逐漸認識到,絕大部分的代謝和調節通路是以蛋白質網絡的形式發揮作用,就是說參與組成通路的蛋白質之間存在著廣泛而頻繁的相互作用。蛋白質與蛋白質相互作用在生物體內具有極其重要的意義,它是蛋白質發揮功能所必需的。各種信號可以在蛋白質相互作用形成的網絡之間完成細胞內、外信號的整閤和傳遞,使得細胞在整體水平上對胞內外的信號産生生物學效應。例如,激素和受體、抗原-抗體反應以及酶與抑製劑的作用等等。從某種意義上可以認為,蛋白質的功能就是通過-係列蛋白質-蛋白質相互作用體現齣來的。因此,對蛋白質間相互作用的研究一直以來都是生物學研究的一個重要方麵。
本書匯總瞭具有多年生物學實驗室工作經驗的研究人員在蛋白質相互作用研究方麵的經驗和心得體會,同時注重吸收藉鑒瞭國際上相關領域最新的進展。
本書從蛋白質相互作用的基本理論開始,到各種經典的蛋白質相互作用的鑒定技術,再到生物信息學的應用,內容涵蓋瞭當前國際上蛋白質相互作用研究領域的各個方麵。書中每個章節的基本內容都包括:引言、原理、實驗材料、詳細步驟、結果分析(實例)、注意要點、疑難分析解答、參考文獻。在編寫過程中,編者力求做到深入淺齣,讓書稿對實驗具有實際指導意義。作者希望本書的齣版能對國內的研究人員在蛋白質功能研究方麵做齣有益的指導。
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