内容简介
《结构生物学(第二版)》以生物大分子(蛋白质、核酸)结构与功能的关系为主线,以结构生物学研究技术为基础,贯穿现代分子生物学原理,讲述结构生物学基本知识、基础理论和研究方法,比较结构生物学研究方法的优势和局限,介绍结构生物学的新成果、新进展、今后发展的趋势及面临的挑战。内容涵盖绪论、核酸结构与功能、蛋白质结构与功能、结构生物学研究技术4部分23章。与国内外已经出版的同类书比较,《结构生物学(第二版)》增加了分子伴侣、第二遗传密码、蛋白质的错误折叠与疾病、蛋白质组学和质谱技术等新章节,并增加了一些最近几年出现的新概念。每章后有小结和思考题,全书后附有结构生物学名词索引和历年结构生物学相关领域Nobel奖获奖情况统计,以方便读者查阅。
《结构生物学(第二版)》可作为综合性大学、理工科大学以及农、林、医院校生命科学学院(生物系)本科高年级学生和研究生学习结构生物学的教材和参考用书,也可供有关教师及科研人员作参考。
内页插图
目录
前言
第1章 绪论
1.1 结构生物学——历史与定义
1.2 结构生物学——进展
1.3 结构生物学——新目标
小结
思考题
第2章 核酸结构的多样性(nucleic acid structure diversity)
2.1 单链核酸分子的结构形态
2.2 双链核酸分子的结构形态
2.3 三链核酸分子的结构形态
2.4 分支的三链核酸复合物
2.5 四链核酸分子的结构形态
2.6 非线型多支链结构
2.7 多聚核苷酸右手螺旋:A型和B型
2.8 Z-DNA
2.9 天然DNA的构象
小结
思考题
第3章RNA的结构(the structure of RNA)
3.1 RNA和DNA的结构差异
3.2 RNA的结构特征
3.3 RNA的一级结构
3.4 RNA的二级结构
3.5 RNA的三级结构
3.6 RNA的折叠
3.7 RNA的晶体结构
3.8 具有催化功能的RNA
小结
思考题
第4章DNA的结构(the structure of DNA)
4.1 DNA的一级结构
4.2 DNA的二级结构
4.3 DNA的三级结构
4.4 四链DNA结构
小结
思考题
第5章 核酸的功能(nucleic acid function)
5.1 核酸分子作为遗传信息载体的功能
5.2 核酶
小结
思考题
第6章 基因组学(genomics)
6.1 人类基因组计划
6.2 基因组的初步分析
6.3 基因组研究的部分内容
6.4 基因组学研究的前景
6.5 结构基因组学(Structural genomics)
小结
思考题
第7章 蛋白质分子的结构(the structures of proteins)
7.1 蛋白质分子的一级结构(primary structure)
7.2 蛋白质分子的二级结构(secondary structure)
7.3 蛋白质分子的三级结构(tertiary structure
7.4 蛋白质分子的四级结构(quaternary structure)
小结
思考题
第8章 蛋白质折叠和分子伴侣(protein folding and molecular chaperones)
8.1 蛋白质和新生肽链折叠的新概念
8.2 帮助蛋白质和新生肽链折叠的生物大分子
小结
思考题
第9章 第二遗传密码(the second genetic code)
9.1 第一遗传密码
9.2 第二遗传密码
9.3 第二遗传密码的研究在实际应用上的意义
小结
思考题
第10章 蛋白质的错误折叠与疾病(protein misfolding and diseases)
10.1 细胞内保证蛋白质正常功能的“质量控制”系统
10.2 与蛋白质错误折叠有关的疾病
10.3 如何治疗由于蛋白质错误折叠引起的疾病
小结
思考题
第11章 蛋白质去折叠(protein unfolding)
11.1 主要研究手段
11.2 促使蛋白质去折叠常用的方法
11.3 蛋白质去折叠研究进展
11.4 质谱法、荧光相图法在研究蛋白质去折叠中的应用
小结
思考题
第12章 蛋白质结构与功能示例(structures and functions of proteins:solne examples)
12.1 超氧化物歧化酶
12.2 ATP合成酶
12.3 DNA依赖的蛋白激酶
小结
思考题
第13章 蛋白质组学(proteomics)
13.1 后基因组学——蛋白质组学研究
13.2 蛋白质组学研究的主要手段
13.3 自动化蛋白质组分析的完整途径
13.4 蛋白质组学研究的现状和前景
小结
思考题
第14章 蛋白质结构预测和分子动力学模拟(protein structure prediction and molecular dynamics simulations)
14.1 蛋白质分子结构的预测
14.2 蛋白质二级结构的预测
14.3 蛋白质三维结构的预测
14.4 蛋白质分子动力学
14.5 蛋白质结构预测实例
14.6 蛋白质结构预测的展望
小结
思考题
第15章 X射线晶体衍射分析(Protein crystallography,X-ray diffraction methods)
15.1 X射线晶体衍射分析概述
15.2 晶体生长和X射线衍射数据收集
15.3 X射线衍射分析
15.4 X射线衍射结构分析举例
15.5 晶体结构的表达
小结
思考题
第16章 核磁共振技术(nuclear magnetic resonance,NMR)
16.1 原子核自旋与核磁共振
16.2多维核磁共振
16.3 核磁共振测定生物大分子的三维结构
小结
思考题
第17章 电镜三维重构(electron microscopy three-dimensional structure rebuilding)
17.1 电镜载网
17.2 负染
17.3 葡萄糖包埋
17.4 单宁酸包埋
17.5 冷冻含水方法
17.6 低剂量电镜术
17.7 三维结构重建的梗概
小结
思考题
第18章 质谱技术(mass spectrometry)
18.1 生物质谱技术
18.2 生物质谱技术应用示例
小结
思考题
第19章 微量热技术(microcalorimetry)
19.1 等温滴定量热法(isothermal titration calorimetry,ITC)
19.2 ITC应用示例
19.3 差示扫描量热法
小结
思考题
第20章 荧光光谱技术(fluorescence spectrometry)
20.1 荧光的产生
20.2 从荧光光谱获得的主要谱参量
20.3 荧光方法的应用
小结
思考题
第21章 圆二色技术(circular dichroism)
21.1 基本原理
21.2 圆二色仪
21.3 圆二色谱在结构生物学研究中的应用
小结
思考题
第22章 扫描隧道显微技术(scanning tunneling microscopy)
22.1 扫描隧道显微镜
22.2 STM应用于研究结构生物学的优点
22.3 STM在结构生物学研究中的应用
22.4 原子力显微技术
小结
思考题
第23章 表面等离子体共振技术(surface plasmon resonance)
23.1 SPR原理
23.2 基于SPR的BIAcore技术
23.3 SPR生物传感器技术的应用
23.4 SPR生物传感器技术中存在的一些问题
23.5 SPR生物传感器的改进
小结
思考题
主要参考文献
结构生物学相关领域Nobel奖历年获奖情况统计
名词索引
彩图
前言/序言
自然界许多有趣现象的发生和人类多种疾病的发病都和具体参与其中的蛋白质结构有关。例如,光是怎样被绿色植物所“俘获”并源源不断为其生长提供能量的?在绿色植物的体内,存在着由膜蛋白、色素分子和脂分子组成的蛋白脂质体复合物,常文瑞院士课题组运用结构生物学的方法,获得了这个“庞大”复合物的晶体结构,发现它是绿色植物俘获光能的有力武器。又如,分子伴侣trigger factor与装配蛋白质的机器——核糖体组成巧妙的复合物,为新生肽链的折叠提供了“分子摇篮”,而该复合物的晶体结构又与我们小时候睡过的摇篮何其相似!
结构生物学是以生物大分子(包括蛋白质和核酸)的特定三维结构及结构的特定运动与其生物学功能的关系为基础来阐明生命现象的科学,是分子生物学的重要组成部分。近年来,结构生物学兴起并逐渐发展成为分子生物学的前沿和主流,从当前发展趋势来看,很可能会成为整个生命科学的前沿和带头学科之一。现在,生命科学的众多分支在运用结构生物学的概念和技术,随着人类基因组计划的提前完成,结构生物学研究进入了一个高潮迭起的时代。
本书以生物大分子(蛋白质、核酸)结构与功能的关系为主线,以结构生物学研究技术为基础,贯穿现代分子生物学原理,讲述结构生物学基本知识、基础理论和研究方法,比较结构生物学研究方法的优势和局限,介绍结构生物学的新成果、新进展、发展的趋势及面临的挑战。内容涵盖绪论(第1章)、核酸结构与功能(第2~6章)、蛋白质结构与功能(第7~14章)、结构生物学研究技术(第15-23章)共4部分23章。其中第8章由王志珍院士编写,第15章由丁怡编写、饶子和院士指导,其余章节由梁毅编写,第16章等部分章节经施蕴渝院士审阅。核酸结构与功能部分阐明RNA和DNA的结构,揭示RNA和DNA生物学功能的大量信息,介绍人类基因组计划的基本概念和背景知识。蛋白质结构与功能部分阐明蛋白质的结构,讲授蛋白质折叠与去折叠的基本规律和分子伴侣、第二遗传密码的基本概念,阐述蛋白质错误折叠导致疾病的分子生物学原理,示例几种蛋白质结构与功能的内在关系,介绍蛋白质组计划的基本概念和背景知识,描述蛋白质结构预测和蛋白质分子动力学的主要方法。结构生物学研究技术系统部分介绍当前结构生物学研究的多种技术,包括X射线晶体衍射分析、核磁共振技术和电镜三维重构3种结构生物学主要研究方法,比较这些技术的优势和局限,从而使读者掌握结构生物学研究技术的基本知识。这些知识和方法不仅是21世纪生物学研究的重要内容,而且将为医药、农业和工业的革新提供崭新的思路。
对于大学本科教育来说,本书旨在通过传授知识、培养能力和提高素质为一体的教学,使学生不仅较好地获得结构生物学知识,而且在能力和素质方面有较大提高,学习目的明确,以较好的综合素质、较高的学习兴趣、较扎实的知识基础和良好的学习状态进入以后研究生阶段的学习课程。
与国内外已经出版的同类书籍比较,本书增加了分子伴侣、第二遗传密码、蛋白质的错误折叠与疾病、蛋白质去折叠、蛋白质组学和蛋白质结构预测等新章节,从而突出了蛋白质结构与功能在结构生物学的主导地位,并增加了一些最近几年出现的新概念。本书还增加了质谱技术、微量热技术和表面等离子体共振技术等新的结构生物学研究技术,使全书的内容更加丰富。另外,本书也尽量避免了与分子生物学和生物化学等相关教材部分内容重叠问题。
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