發表於2024-11-05
第1章 計算機與化學
1.1 計算機與化學
1.1.1 計算機化學
1.1.2 計算化學
1.1.3 理論化學
1.1.4 量子化學
1.2 計算機化學的發展
1.3 我國計算(機)化學的發展概況
1.4 分子模擬與量化計算簡介
1.4.1 分子模擬的意義
1.4.2 分子模擬的一般過程
1.4.3 分子模型的構建
1.4.4 分子模擬的方法
1.5 常用化學軟件簡介
1.5.1 化學圖文設計軟件
1.5.2 計算化學與分子模擬軟件
1.5.3 化學數據庫
1.5.4 圖譜解析軟件
1.5.5 數據處理軟件
1.5.6 文獻管理軟件
1.6 計算化學應用
1.7 計算機化學的學習方法
1.8 相關網站及參考書
第2章 ChemSketch的使用
2.1 ChemSketch概述
2.1.1 主要功能
2.1.2 軟件界麵
2.2 結構模式
2.2.1 常用工具與快捷按鈕
2.2.2 基本操作
2.2.3 高級操作
2.2.4 二維優化
2.2.5 三維優化
2.2.6 模闆的應用
2.2.7 模闆的管理
2.3 繪圖模式
2.3.1 常用工具與快捷按鈕
2.3.2 反應能量圖
2.3.3 原子軌道圖
2.3.4 實驗裝置圖
2.4 分子性質的預測
第3章 ChemBioDraw的使用
3.1 ChemBioDraw概述
3.1.1 版本介紹
3.1.2 運行係統要求
3.1.3 新特性
3.2 ChemBioDraw工具欄與文檔
3.2.1 工具欄與窗口顯示
3.2.2 文檔操作
3.2.3 頁麵設置
3.3 ChemBioDraw操作實例
3.3.1 畫丙酮分子
3.3.2 使用環工具
3.3.3 畫反應式
3.3.4 畫中間體
3.3.5 使用碎片工具
3.3.6 畫多點配位結構
3.3.7 費歇爾投影式
3.3.8 畫透視圖
3.3.9 畫紐曼投影式
3.3.10 使用立體化學標記
3.3.11 使用模闆
3.4 結構式的基本畫法
3.4.1 選擇對象
3.4.2 化學鍵
3.4.3 環
3.4.4 脂肪鏈
3.4.5 畫DNA、RNA序列
3.4.6 展開標簽與壓縮標簽
3.4.7 說明文本與原子標注
3.5 結構式的高級技法
3.5.1 連接對象
3.5.2 組閤對象
3.5.3 反映結構
3.5.4 整理結構
3.5.5 原子編號
3.5.6 使用模闆
3.5.7 定義彆名
3.5.8 三維預覽
3.6 查詢結構
3.6.1 原子屬性
3.6.2 鍵屬性
3.6.3 通用彆名
3.6.4 列錶元素
3.6.5 聚閤物錶示法
3.6.6 替換基團
3.6.7 展開查詢結構
3.6.8 反應映射圖
3.7 結構與性質
3.7.1 檢查結構
3.7.2 分析窗口
3.7.3 估算化學性質
3.7.4 體化學性質
3.7.5 化學計量網格
3.7.6 從結構到命名
3.7.7 從命名到結構
3.7.8 估算NMR的化學位移
3.8 繪圖工具的使用
3.8.1 軌道工具
3.8.2 化學符號工具
3.8.3 箭頭與麯綫工具
3.8.4 基本繪圖工具
3.8.5 括號工具
3.8.6 TLC工具
3.8.7 生物繪圖工具
第4章 ChemBio3D的使用
4.1 ChemBio3D簡介
4.1.1 版本介紹
4.1.2 量化程序接口
4.1.3 新特性
4.2 ChemBio3D基礎
4.2.1 ChemBio3D主界麵
4.2.2 菜單命令
4.2.3 工具欄
4.3 ChemBio3D實例
4.3.1 熟悉ChemDraw麵闆
4.3.2 使用畫鍵工具和鏇轉工具
4.3.3 使用文本工具
4.3.4 分析乙烷的構象
4.3.5 使用二麵角驅動器
4.3.6 重疊模型
4.3.7 對接模型
4.3.8 HOMO和LUMO軌道
4.3.9 繪製錶麵圖
4.3.10 局部電荷
4.4 模型的創建
4.4.1 設置構建模型的選項
4.4.2 使用鍵工具建模
4.4.3 使用ChemDraw麵闆
4.4.4 使用文本工具建模
4.4.5 使用坐標錶建模
4.4.6 模型坐標
4.4.7 參數錶與測量錶
4.5 模型的修改
4.5.1 選擇對象
4.5.2 改變元素
4.5.3 改變鍵級
4.5.4 添加分子碎片
4.5.5 使用測量錶
4.5.6 設置電荷
4.5.7 原子編號
4.5.8 改變立體化學構型
4.5.9 優化模型
4.5.10 顯示和隱藏原子
4.5.11 移動模型
4.5.12 鏇轉模型
4.5.13 改變模型大小
4.6 模型的顯示
4.6.1 結構顯示
4.6.2 分子錶麵顯示
4.6.3 彈齣信息
4.6.4 查看測量錶
4.6.5 查看原子屬性錶
4.6.6 查看分子內坐標錶
4.6.7 查看笛卡兒坐標錶
4.6.8 模型瀏覽器
4.6.9 結構瀏覽器
4.6.10 偏離平麵
4.7 模型的輸齣
4.7.1 打印與保存
4.7.2 復製與封裝
4.8 分子模擬入門
4.8.1 計算方法概述
4.8.2 分子力學理論
4.8.3 分子動力學模擬
4.9 MOPAC計算接口
4.9.1 計算實例
4.9.2 能量最小化
4.9.3 優化到過渡態
4.9.4 選擇方法
4.9.5 計算性質
4.9.6 文件管理
4.10 Gaussian計算接口
4.10.1 Gaussian接口
4.10.2 能量最小化計算
4.10.3 優化到過渡態
4.10.4 計算性質
4.10.5 創建輸入文件
4.10.6 運行輸入文件
4.10.7 查看輸齣結果
第5章 Gaussian的使用
5.1 Gaussian概述
5.1.1 軟、硬件要求
5.1.2 硬盤分區方案
5.1.3 安裝軟件
5.1.4 指定Scratch文件目錄
5.1.5 設置內存和硬盤空間
5.1.6 Gaussian03的鏈接
5.2 啓動Gaussian程序
5.2.1 啓動程序
5.2.2 工作環境初始化設置
5.3 創建Gaussian輸入文件
5.3.1 使用GO3W創建
5.3.2 使用ChemBio3D創建
5.3.3 使用GaussView創建
5.3.4 使用文本編輯器
5.4 執行Gaussian計算作業
5.4.1 在GO3w中運行
5.4.2 在ChemBio3D中運行
5.4.3 在GaussView中運行
5.5 查看Gaussian計算結果
5.5.1 用文本編輯器查看
5.5.2 用GaussView顯示分子的振光譜和NMR譜
5.5.3 用HyperChem進行簡振模式分析
5.5.4 用ChemBio3D顯示計算結果
5.6 運用Gaussian的基本技巧
5.6.1 [Utilities]菜單命
5.6.2 配閤使用的輔助軟件
5.6.3 輔助軟件聯用
5.7 Gaussian應用實例
5.7.1 單點能計算
5.7.2 幾何優化
5.7.3 頻率計算
5.7.4 高精度計算
5.7.5 化學反應研究
5.7.6 激發態計算
5.7.7 溶液中的反應
第6章 GaussView的使用
6.1 GaussView基礎
6.1.1 分子集、模型和視圖
6.1.2 菜單命令與工具欄
6.1.3 GaussView參數選擇
6.2 構建分子
6.2.1 使用工具麵闆
6.2.2 構建分子實例
6.2.3 查看與調整結構參數
6.2.4 高級構建功能
6.3 顯示與保存分子視圖
6.3.1 管理分子視圖
6.3.2 文件操作
6.3.3 打印及保存圖片
6.3.4 指定默認文件位置
6.4 創建Gaussian作業
6.4.1 計算設置麵闆
6,4.2 設置特殊任務
6.4.3 為作業設置默認值
6.4.4 快速運行作業
6.4.5 觀察和控製計算
6.4.6 指定如何運行CO3w
6.5 查看Gaussian結果
6.5.1 顯示結果數據摘要
6.5.2 顯示原子電荷
6.5.3 顯示錶麵和等高綫
6.5.4 顯示振動模式及光譜
6.5.5 顯示NMR光譜
6.5.6 顯示紫外可見光譜
6.5.7 查看其他圖形
附錄 能量單位
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評分還不錯!!!!!!!
評分很好 送貨及時 書沒問題
評分不錯的書籍,專業性強。
評分還沒來得及看,應該是好書,反正京東不錯,書的內容沒看,無法評價
評分東西不錯,速度也挺快,下次還來
評分自20世紀80年代DOS操作係統問世以來,尤其是90年代中期Windows操作係統的誕生,加上計算機硬件技術的飛速發展,整個計算機係統得到瞭空前的完善,人類社會的生活方式也發生瞭革命性變化,互聯網把整個世界連成一體,計算機不再是少數高級專門研究人員的特殊工具,已成為普通人群必不可少的工作平颱。目前,化學研究人員可以在計算機上方便地開展研究工作,從而誕生瞭與計算機相關的眾多化學分支學科,促進瞭研究手段、研究方法的不斷更新和完善,並逐步産生瞭一些新的名詞和術語,如計算機化學、計算化學、化學信息學、化學數據庫等。
評分不錯不錯不錯不錯不錯不錯
評分主要是看中瞭書中關於Gaussian03及GaussView的使用一章纔買的。至於書名個人感覺與內容不符。化學圖文設計通常的化學科研人員都會用,另外書中講的高斯軟件的使用時量子化學計算的內容,跟分子模擬不搭調的。
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