宿主與細菌的相互作用 [Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols] 下載 mobi epub pdf 電子書 2025

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[法] 安尼特·沃根斯特（Annette C.Vergunst） 著，鄭福英，陳啓偉，宮曉煒 譯

圖書標籤:

• 宿主-細菌相互作用
• 微生物組
• 免疫學
• 感染
• 病原體
• 分子生物學
• 細胞生物學
• 實驗方法
• 研究方法
• 醫學

齣版社： 中國農業科學技術齣版社

ISBN：9787511628411

版次：1

商品編碼：12165164

包裝：平裝

外文名稱：Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols

開本：16開

齣版時間：2016-12-01

用紙：膠版紙

頁數：313

字數：492000

正文語種：

內容簡介

　　《宿主與細菌的相互作用》闡述瞭一係列研究宿主和細菌互作的*前沿的方法，覆蓋哺乳動物、新型非哺乳動物感染模型、細胞生物學、組學及細菌遺傳學。其目的就是提供一種技術途徑，涉及細菌感染的病理生理學多方麵操作技術，從動物整體水平到組織水平、細胞水平及分子水平。用於這些前沿技術的病原微生物很廣泛，並非隻是那些我們想試圖闡明胞內感染機製的胞內寄生菌和兼性寄生菌。所以，每個章節介紹的操作技術可適用於大多數病原微生物。《宿主與細菌的相互作用》旨在為廣大科研人員提供優化的實驗操作步驟，以確保實驗的成功；對實驗方法部分，包括每一操作步驟進行瞭詳盡的描述；而注釋部分是實驗操作人員親自操作總結齣來的實驗心得和技巧，也是對實驗方法的一個補充，可幫助大傢更好地解決實驗中齣現的問題和睏難。

內頁插圖

目錄

第一篇 通過感染模型研究細菌的毒力
第一章 用大蠟螟作為感染模型進行篩選
1 前言
2 材料
2．1 細菌菌株和昆蟲
2．2 注射裝置和設備
2．3 細菌生長和溶液的配製
3 研究方法
3．1細菌準備
3．2 大蠟螟的準備和感染
注釋
參考文獻

第二章 腸道感染的動物模型——果蠅
1 前言
2 材料
2．1 果蠅的培養
2．2 果蠅的品係和處理
2．3 細菌培養
2．4 經口感染和生存分析
2．5 血淋巴中的細菌計數
2．6 吞噬作用的阻滯
2．7 腸道解剖
2．8 腸道固定
2．9 腸道免疫染色
2．10 將解剖後的腸道置於顯微鏡載玻片上，並進行成像和數據分析
2．11 SYTOX Green分析
2．12 Smurf試驗
2．13 RNA提取
2．14 蛋白質提取
2．15 BONCAT方法監測整體的蛋白翻譯
2．16 監測copper細胞區域的酸化
3 方法
3．1 經口感染
3．2 生存分析
3．3 果蠅體內全部的菌量
3．4 血淋巴中的細菌計數
3．5 腸上皮內的細菌數
3．6 吞噬作用的阻滯
3．7 腸道解剖
3．8 腸道的封閉和免疫染色
3．9 腸道組織塗片
3．10 SYTOX Green方法檢測上皮的完整性
3．11 Smurf試驗檢測消化道的完整性
3．12 從成年果蠅的中腸提取RNA
3．13 從解剖的腸道中提取蛋白質
3．14 通過BONCAT方法監測蛋白質的閤成
3．15 監測果蠅中腸泌酸區域的生理功能
注釋
緻謝
參考文獻

第三章 斑馬魚胚胎作為動物模型研究細菌毒力
1 前言
1．1 顯微注射
2 材料
2．1 取卵並準備注射
2．2 細菌培養和培養液的準備
2．3 顯微注射
2．4 細菌增殖的分析
2．5 生存分析和活體成像的工具
2．6 qRT-PCR和RNA-Seq分析
3 方法
3．1 獲取魚卵並準備感染實驗的胚胎
3．2 培養洋蔥伯剋氏菌用於感染及接種液的準備
3．3 顯微注射
3．4 胚胎生存研究
3．5 測定細菌增殖解讀細菌的毒力
3．6 在感染期的實時觀測
……

第二篇 宿主與細菌在細胞層麵的相互作用
第六章 Cre報告基因分析易位（CRAfT）：一種用於研究宿主細胞內蛋白轉運的工具
第七章 宿主與細菌蛋白間相互關係的檢測：真核核仁蛋白與弗朗西斯菌屬延長因子Tu的相互作用
第八章 劫持宿主蛋白酶體以時序性降解細菌效應蛋白
第九章 軍團杆菌感染期磷酸肌醇動力學活細胞成像
第十章 細菌蛋白乾擾細胞凋亡的研究
第十一章 基於雙分子熒光互補技術研究植物宿主內的微生物病原體蛋白質互作成像
第十二章 細菌感染小鼠樹突狀細胞的TLR信號應答研究第三篇 組學與大規模篩查
第十三章 利用果蠅細胞siRNA篩選鑒定宿主感染所需的因素
第十四章 胞內細菌的純化：從宿主細胞中分離有活性的流産布魯氏菌
第十五章 對斑馬魚感染模型流式細胞分選（FACS-Sorted）免疫細胞群RNA測序以識彆細胞對細胞內病原體的特異性反應
第十六章 細菌高通量鳥槍蛋白質組學分析的捷徑
第十七章 PATRIC生物信息學資源中心的比較基因組分析
……
第三篇 組學與大規模篩查
第四篇 難治性細菌的研究方法

前言/序言

　　細菌感染是宿主和病原之間一種復雜的互作過程。在過去的20年中，通過細菌遺傳學、細胞生物學、免疫學以及宿主生理學各學科知識的整閤，我們對傳染性疾病緻病機理有瞭更深刻的認識：同時也引導瞭“細胞微生物學”這一新領域的發展。早期科研主要從研究較為充分的沙門氏菌、誌賀氏菌、李氏杆菌及簡單的細胞模型Hela細胞開始。然而，這一領域的研究很快擴展到瞭其他病原菌及細胞係中。細胞微生物學有助於鑒定參與互作的細菌毒力因子和宿主靶標，以及這種互作是如何調節細胞並協助病原微生物的。最新的科研動態分彆從細胞水平、組織水平及整體動物水平，對體內感染的病原生物進行瞭詳盡的研究。
　　本書闡述瞭一係列研究宿主和細菌互作的最前沿的方法，覆蓋哺乳動物、新型非哺乳動物感染模型、細胞生物學、組學及細菌遺傳學。其目的就是提供一種技術途徑，涉及細菌感染的病理生理學多方麵操作技術，從動物整體水平到組織水平、細胞水平及分子水平。用於這些前沿技術的病原微生物很廣泛，並非隻是那些我們想試圖闡明胞內感染機製的胞內寄生菌和兼性寄生菌。所以，每個章節介紹的操作技術可適用於大多數病原微生物。本書旨在為廣大科研人員提供優化的實驗操作步驟，以確保實驗的成功；對實驗方法部分，包括每一操作步驟進行瞭詳盡的描述；而注釋部分是實驗操作人員親自操作總結齣來的實驗心得和技巧，也是對實驗方法的一個補充，可幫助大傢更好地解決實驗中齣現的問題和睏難。
　　早期的研究證明。感染模型可以幫助我們更好地認識傳染病，而近些年，研究的焦點已從經典的哺乳動物、哺乳動物細胞模型轉嚮無脊椎動物模型；本書第一篇的第一章和第二章介紹瞭感染模型小蠟螟幼蟲和果蠅的運用；而在第二篇中介紹瞭非動物模型阿米巴原蟲（第九章）及植物（第六章、第十一章）。斑馬魚是最新齣現的一種感染動物模型，第三章介紹瞭研究人員利用斑馬魚遺傳背景清晰及胚胎通體透明的特點，在感染後實時從細胞和動物水平評估宿主和病原體的互作。活體成像技術的進步促進瞭哺乳動物體內成像的發展，第四章介紹瞭使用高敏感度相機可以觀察動物體內發光的細菌或細胞.而第五章介紹瞭雙光子顯微鏡觀察活體組織內細胞改變的相關內容。
　　為瞭全麵認識細菌的毒力.從細胞和分子水平研究宿主和病原微生物的相互作用是必不可少的（第二篇）；通過植物和酵母細胞等一些替代模型，可以篩選和鑒定齣在細菌分泌係統作用下發生易位的細菌蛋白和效應因子，並闡明細菌調控宿主防禦係統以實現自身在體內繁殖的機製（第六章）；第七章介紹瞭當細菌毒力因子位於病原體錶麵或注入細胞內時，可以通過一種方法鑒定細菌毒力因子宿主靶位點的方法；同時也介紹瞭一些病原菌是如何調控細胞關鍵流程的，包括蛋白通過蛋白酶體降解（第八章）、’磷酸肌醇動力學（第九章）和細胞凋亡（第十章）；運用雙分子互補技術，可以鑒定活體內相互作用的宿主和細菌蛋白。另外，本書還介紹瞭一種檢測病原微生物通過TLR信號通路調節宿主先天性免疫途徑的方法（第十二章）。
　　技術的進步引發瞭組學復雜數據的大爆炸（第三篇）。第十三章介紹果蠅細胞係可用於小RNA分子篩選，這有助於鑒定參與感染的宿主因子；第十四章介紹瞭如何從感染的細胞中純化細菌，並用於蛋白質組和轉錄組分析；第十五章介紹瞭用流式細胞儀分選斑馬魚胚胎中吞噬細胞，並用於轉錄組的分析。本書還涉及瞭高通量蛋白質組學分析時樣品的快速製備以及數據提取的方法（第十六章）；而這些研究所産生的大量數據，需要強大的生物信息學背景纔能挖掘；第十七章介紹瞭細菌生物信息學資源中心（PATRIC），它是美國國立衛生研究院資助的數據庫，緻力於病原微生物的組學分析。
　　細菌病原體的遺傳操作對闡明細菌與宿主互作的分子機製是至關重要的（第四篇）。本書的第十八章至第二十章介紹瞭調控專性細胞內寄生菌的技術。
　　在此要感謝所有為這本書做齣貢獻的科研人員，是他們推動這個領域的科研進步，並用他們專業的知識為大傢提供瞭詳盡的實驗方案、操作步驟及實驗心得。同時也非常感謝分子生物學部門的主編JohnWalker博士，感謝他給我們這次機會編著《宿主與細菌的相互作用》一書並給予的大力支持。
　　希望大傢都能喜歡這本分子生物學著作。

好的，這是一份關於圖書《宿主與細菌的相互作用：方法與方案集》的詳細圖書簡介，內容完全圍繞該書所涵蓋的主題展開，不包含任何與該書主題無關的信息，旨在提供一本專業、嚴謹的科學參考書概述。 --- 《宿主與細菌的相互作用：方法與方案集》圖書簡介 導言：探索微觀世界的動態平衡 人體和環境中的微生物群落是生命係統中不可或缺的組成部分。宿主與細菌之間的復雜、動態的相互作用，構成瞭健康、疾病以及生態平衡的基礎。從腸道菌群對營養代謝的調控，到病原體感染引發的免疫應答，再到微生物組在環境適應中的作用，理解這些相互作用的分子機製和實驗方法至關重要。《宿主與細菌的相互作用：方法與方案集》匯集瞭該領域前沿且經過驗證的實驗技術和研究方案，旨在為微生物學、免疫學、細胞生物學及相關領域的研究人員提供一套全麵、實用的操作指南。 本書的定位是為實驗室研究者提供詳細、可操作的“操作手冊”，涵蓋瞭從微生物培養到復雜的體內外相互作用研究的全過程。它不僅介紹瞭研究這一復雜係統的理論背景，更側重於實驗設計的優化、關鍵步驟的精確執行以及數據分析的規範化。 第一部分：基礎技術與微生物培養策略 本部分聚焦於研究所需的基石技術，確保研究者能夠成功地獲取、培養和鑒定相互作用中的關鍵微生物。 微生物的培養與鑒定： 厭氧與需氧菌培養： 詳細闡述瞭不同類型的細菌（特彆是難以培養的微生物，如腸道共生菌）在不同氣體環境下的培養條件優化。這包括厭氧箱、燭缸係統、以及特定培養基（如哥倫比亞瓊脂、血瓊、M9 最小培養基）的製備與優化。 菌株的純化與保存： 提供瞭從復雜樣本（如糞便、組織勻漿）中分離純培養物的逐步指南，以及高效的凍乾、甘油冷凍保存技術，以維持菌株的遺傳穩定性和生物學活性。 分子鑒定技術： 涵蓋瞭基於 16S rRNA 基因測序、全基因組測序（WGS）以及質譜（MALDI-TOF MS）的細菌鑒定標準操作流程（SOP），確保物種和菌株級彆的準確鑒定。 宿主細胞係的準備與維護： 上皮細胞與免疫細胞培養： 介紹瞭不同來源的宿主細胞（如 Caco-2、HT-29、巨噬細胞係 RAW264.7、J774A.1）的維持、傳代以及功能性誘導方法。特彆強調瞭維持細胞功能的特定培養基組分和血清選擇。 原代細胞分離： 提供瞭從動物模型中分離和培養原代腸上皮細胞、肝細胞或脾髒淋巴細胞的無菌技術和優化方案，以最大限度地模擬生理環境。 第二部分：體外相互作用模型構建與分析 本部分深入探討瞭在受控的體外環境中模擬宿主與細菌相互作用的實驗係統和定量分析方法。 細菌感染與定殖模型： 細菌-細胞共培養（In Vitro Infection Assays）： 詳述瞭細菌感染宿主細胞的經典方法，包括MOI（感染復數）的精確計算與調整、不同時間點下的細胞毒性測定（如 LDH 釋放實驗）。 細胞內生存與轉運研究： 提供瞭抗生素衝洗法（Antibiotic Killing Assay），用於區分細胞外和細胞內細菌，並結閤熒光標記技術追蹤細菌在宿主細胞內的遷移路徑。 生物膜（Biofilm）形成與解聚： 詳細介紹瞭微量滴定闆法和流式細胞術（CLSM）在評估細菌生物膜形成能力和對抗生素/免疫細胞攻擊抵抗力方麵的應用。 免疫學相互作用的體外研究： 宿主免疫細胞激活測定： 針對特定細菌成分（如 LPS、肽聚糖、鞭毛蛋白）刺激巨噬細胞或樹突狀細胞，測量關鍵細胞因子（如 TNF-$alpha$、IL-6、IL-1$eta$）的釋放。方案中包含瞭 ELISA、Luminex 多重分析以及 qPCR 的標準化流程。 吞噬作用與清除實驗： 利用熒光標記細菌或 Opsonization（調理）技術，定量測定宿主細胞對細菌的吞噬效率，以及隨後的溶酶體融閤與細菌清除過程。 第三部分：體內模型與高通量錶徵技術 研究宿主與細菌在活體內的動態相互作用需要精確的動物模型和先進的成像與組學技術。 動物模型構建與操作： 無菌（Germ-Free）與定殖（Colonization）動物模型： 詳細說明瞭無菌小鼠的維持、轉移技術，以及嚮傳統小鼠模型中口服定殖特定細菌菌株的方法，包括定殖效率的評估指標（如糞便菌群負荷）。 感染與緻病性模型： 提供瞭評估細菌毒力所需的LD50（半數緻死劑量）測定流程，以及誘導特定感染部位（如肺部、腸道）炎癥反應的方案，並強調瞭人道倫理規範的遵守。 遺傳工程動物的應用： 介紹瞭使用條件性基因敲除小鼠（如 Cre-LoxP 係統）研究特定宿主因子（如 TLRs、NOD2）在細菌相互作用中作用的實驗設計。 先進的組學與成像分析： 宏基因組學與代謝組學： 闡述瞭從糞便、組織或體液樣本中提取高質量 DNA/RNA 的方法，用於宏基因組測序（Shotgun Metagenomics）以解析菌群結構，以及非靶嚮/靶嚮代謝組學以鑒定細菌和宿主産生的關鍵代謝物（如短鏈脂肪酸、膽汁酸）。 空間轉錄組學與免疫組化（IHC/IF）： 提供瞭在組織切片上定位特定細菌群落並同時分析宿主免疫細胞浸潤的聯閤染色方案。著重介紹瞭使用FISH（熒光原位雜交）技術可視化特定細菌在組織微環境中的空間分布。 第四部分：數據分析、生物信息學與定量評估 成功的相互作用研究依賴於對復雜數據的準確解釋。本部分提供瞭從原始數據到有意義生物學結論的轉化工具。 微生物組數據處理流程： 質量控製與去噪： 16S rRNA 或 WGS 原始序列數據的清洗、去噪、比對和操作分類單元（OTU）或物種分配的標準流程。 多樣性與功能分析： 提供瞭 Alpha（內群落）和 Beta（群落間）多樣性指標的計算（如 Chao1, Shannon, PCoA），以及基於 PICRUSt 或 Tax4Fun 的宏基因組功能預測方法。 宿主反應的定量評估： 生物統計學基礎： 強調瞭在比較不同實驗組（如處理組 vs. 對照組）時，應采用的統計檢驗方法（如 T 檢驗、ANOVA、非參數檢驗）的選擇準則，以及數據正態性檢驗的重要性。 通路富集分析： 指導研究者如何利用 KEGG、GO 數據庫對功能基因或宿主免疫通路數據進行富集分析，以識彆相互作用的關鍵調控網絡。 結論與展望 《宿主與細菌的相互作用：方法與方案集》不僅是一本方法匯編，更是該領域研究策略的綜閤體現。通過提供從基礎培養到前沿組學分析的完整框架，本書緻力於推動研究者們以更高標準、更嚴謹的方法，去揭示宿主與細菌共存係統中隱藏的生命規律。本書的價值在於其即時性和可重復性，確保研究工作能夠穩健、可靠地推進，最終加深我們對健康維護和疾病乾預的理解。

評分☆☆☆☆☆

《宿主與細菌的相互作用 [Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols]》這個書名，如同一個精心設計的邀請函，邀請讀者走進一個充滿未知與驚喜的科學領域。作為一名熱衷於探索生命奧秘的愛好者，我一直對微生物與宿主之間的復雜關係深感著迷。我們身體就像一個微型宇宙，棲息著數量龐大、種類繁多的細菌，它們既可以是健康的守護者，也可以是疾病的製造者。要理解這一切，僅僅停留在理論層麵是遠遠不夠的，必須要有實操的依據和規範的方法。《宿主與細菌的相互作用 [Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols]》似乎正是為此而生。我期待著在這本書中找到解答，比如，書中是否會提供詳細的步驟來培養和分離特定的細菌群落？是否會介紹如何利用 CRISPR-Cas9 等基因編輯技術來深入探究宿主或細菌基因的功能？是否會涵蓋各種先進的成像技術，例如超分辨率顯微鏡，來觀察微觀層麵的細胞互動？我希望這本書能以清晰、簡潔的方式，帶領我一步一步地掌握這些關鍵的研究方法，讓我能夠更有信心地去設計實驗，分析數據，並最終在科學研究的道路上取得突破，去揭示宿主與細菌之間那令人著迷的互動機製，從而為理解生命、疾病以及健康帶來新的啓示。

評分☆☆☆☆☆

這本《宿主與細菌的相互作用》的書名一聽就讓人心生好奇，尤其是“方法與協議”這幾個字，暗示著這本書並非泛泛而談，而是深入到實際操作層麵。作為一名對微生物領域抱有極大熱情的學生，我一直希望能找到一本既有理論深度，又能指導實踐的教材。閱讀這本書的書名，我腦海中浮現齣無數的場景：實驗室裏，我可能正準備著進行一次復雜的共培養實驗，需要精確控製條件；或者在顯微鏡前，仔細觀察宿主細胞與入侵的細菌之間微妙的動態變化；又或者在分析海量基因組數據，試圖解開隱藏在錶象之下的互作機製。這本書似乎就是為解決這些實際難題而生，它可能教會我如何設計嚴謹的實驗，如何選擇最閤適的檢測手段，以及如何規範地記錄和分析結果。想到這裏，我迫不及待地想翻開它，去瞭解那些隱藏在“宿主與細菌相互作用”背後的科學方法，希望它能成為我探索這個復雜而迷人世界的得力助手，幫助我剋服研究中的種種挑戰，從理論走嚮實踐，在分子層麵理解這對古老搭檔的恩怨情仇。

評分☆☆☆☆☆

這本書的書名《宿主與細菌的相互作用 [Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols]》立刻抓住瞭我的眼球，因為它觸及瞭一個我長期以來深感興趣，卻又覺得門檻頗高的領域。我一直對生物體內部的微觀世界充滿瞭敬畏，特彆是那些數量龐大、功能多樣的細菌，它們與我們的身體之間並非簡單的“寄生”或“共生”關係，而是復雜而動態的相互作用。這本書的副標題“方法與協議”更是讓我看到瞭希望，它暗示著這本書將提供一套係統性的指導，幫助研究者掌握探索這些相互作用的先進技術和實驗流程。我常常想象，這本書中會詳細介紹如何分離和培養特定的細菌菌株，如何利用先進的成像技術來可視化它們在宿主細胞內的活動，甚至是如何通過分子生物學手段來揭示信號傳導通路和免疫應答機製。它可能還會涵蓋如何進行宏基因組學分析，以研究腸道微生物群落的組成及其與宿主健康的關係。總而言之，我期待這本書能像一位經驗豐富的導師，一步一步地引導我，讓我能夠自信地投入到宿主與細菌相互作用的研究中，揭開這個領域令人著迷的奧秘。

評分☆☆☆☆☆

《宿主與細菌的相互作用 [Host-Bacteria Interactions Methods and Protocols]》這個書名，讓我想象到瞭一種能夠連接基礎理論與實際操作的橋梁。作為一名對生命科學前沿研究充滿好奇心的旁觀者，我對宿主與細菌之間那盤根錯節的關係始終感到著迷。我們身體的每一個角落都棲息著無數的微生物，它們扮演著至關重要的角色，從幫助消化到塑造免疫係統，甚至影響著我們的情緒和行為。然而，要深入理解這些微觀世界的互動，絕非易事。這本書的齣現，似乎為我們提供瞭一套“操作手冊”，讓我們能夠以一種科學、嚴謹的方式去探究這些復雜的生命過程。我腦海中浮現齣無數的可能性：這本書是否會詳細講解如何利用基因編輯技術來探究特定細菌基因的功能？是否會介紹如何進行高通量篩選，以識彆能夠影響宿主細胞行為的細菌信號分子？又或者，它是否會提供一套標準化的實驗方案，讓我們能夠重現那些令人驚嘆的研究成果？我渴望從這本書中獲得知識和啓發，去理解那些隱藏在微生物世界背後的精密機製，去探索它們如何與宿主共同演化，共同生存，甚至共同進化，為理解生命本身的復雜性提供新的視角。

評分☆☆☆☆☆

“宿主與細菌的相互作用”——這個標題本身就勾勒齣一幅宏大的畫捲，而“方法與協議”則將其具象化，指嚮瞭具體的科學實踐。我一直以來都對微生物學，特彆是其中與人類健康息息相關的部分充滿瞭濃厚的興趣。我們知道，人體並非一個孤立的生態係統，而是與數以萬億計的細菌共同構成瞭復雜的微生態平衡。這種平衡一旦被打破，就可能引發各種疾病。這本書的齣現，仿佛是一本“探險指南”，為我打開瞭一扇通往更深層次理解的大門。我猜測，它會詳盡地介紹各種先進的實驗技術，比如如何精確地分離鑒定特定的細菌，如何利用流式細胞術來分析細菌與宿主細胞的相互作用，或者如何使用質譜技術來檢測相互作用産生的代謝産物。它甚至可能涵蓋如何設計和執行一項涉及基因組學、轉錄組學或蛋白質組學的大規模研究，以全麵解析宿主與細菌之間的復雜調控網絡。我期待這本書能讓我掌握這些前沿的研究工具，去親身感受那些肉眼看不見的生物化學反應和信號傳遞，去揭示宿主與細菌之間那份微妙而深刻的共生或對抗的真相，並最終將這些知識轉化為對人類健康的深刻洞察。