杆状病毒分子生物学(第三版)

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[美] 罗尔曼 著,吴小锋,沈运旺,张健家 译
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出版社: 浙江大学出版社
ISBN:9787308151696
版次:3
商品编码:11838142
包装:平装
开本:16开
出版时间:2015-12-01
用纸:胶版纸

具体描述

内容简介

  罗尔曼编著的《杆状病毒分子生物学(第3版)》内容丰富,知识新颖,共十五章,包括杆状病毒简介、分类和进化;杆状病毒包涵体和病毒粒子的结构蛋白;杆状病毒复制周期:对细胞和昆虫的影响;病毒感染的早期事件:病毒转录;病毒DNA复制和基因组加工;杆状病毒的晚期转录;杆状病毒感染:细胞周期和凋亡;宿主抗性、易感性以及病毒感染对宿主分子生物学的影响;杆状病毒作为杀虫剂;杆状病毒表达技术:原理与应用;杆状病毒、逆转录病毒、DNA转座子和昆虫细胞;AcMNPV基因组:基因含量、保守性和功能;与AcMNPV基因组不同源的部分杆状病毒基因:保守性和功能;专业词汇;已测序的杆状病毒基因组和常见杆状病毒的宿主昆虫等。

目录

第一章 杆状病毒简介、分类和进化
一、杆状病毒的发现历程
二、定义不在名字中:命名杆状病毒
三、用什么定义杆状病毒?
四、杆状病毒的多样性
五、相关病毒
参考文献
第二章 杆状病毒包涵体和病毒粒子的结构蛋白
一、包涵体的进化
二、包涵体蛋白
三、多角体相关蛋白
四、杆状病毒的病毒粒子:囊膜蛋白
五、核衣壳的结构
六、所有杆状病毒均编码的BV和ODV核衣壳相关蛋白
七、宿主蛋白质和蛋白质修饰
参考文献
第三章 杆状病毒复制周期:对细胞和昆虫的影响
一、昆虫的中肠
二、两种类型的病毒粒子
三、从包涵体到易感的中肠细胞
四、进入细胞核
五、从细胞出芽形成BV
六、引发全身感染的病毒
七、参与感染周期的病毒蛋白
八、出芽型病毒与细胞内病毒,它们是否存在转变?
九、包埋,病毒感染的最终阶段
十、病毒的扩散
十一、GV的病理学
十二、仅限于中肠感染的病毒:膜翅目和双翅目昆虫的NPV
十三、持续的、潜在的、隐蔽的杆状病毒感染
参考文献
第四章 病毒感染的早期事件:病毒转录
一、转录活化子、增强子和宿主RNA聚合酶
二、杆状病毒的感染:对宿主细胞基因表达的选择性影响
三、杆状病毒的转录级联反应:一种新策略的进化
四、转录增强子
五、杆状病毒的增强子:同源重复序列(hrs)
六、早期基因的一个主要转录活化因子,即刻早期基因1(IE-1,Acl47)
七、IE-1结合到hr序列
八、调控早期病毒基因转录的RNA聚合酶Ⅱ信号
九、杆状病毒的全基因组分析
十、早期基因的有序表达
十一、其他说明和限制条件
参考文献
第五章 病毒DNA复制和基因组加工
一、病毒DNA复制起始位点的鉴定
二、DNA合成的必需基因
三、影响DNA复制的其他基因
四、杆状病毒的DNA复制基因:缺少了什么?
五、杆状病毒DNA复制的位置:病毒发生基质的形成
六、其他的杆状病毒基因:DNA修复的提示
七、参与核苷酸生化合成的基因
八、杆状病毒的基因组是如何被复制的?
九、基于重组的复制的影响:多个复制起点,共价封闭的环状基因组,以及每个囊膜中含有多个核衣壳
十、基因组DNA的加工和包装
十一、更多尚未回答的问题
参考文献
第六章 杆状病毒的晚期转录
一、杆状病毒晚期基因的活化
二、杆状病毒的晚期启动子元件
三、昆虫病毒的RNA聚合酶和包涵体蛋白的超表达
四、杆状病毒的RNA聚合酶
五、RNA聚合酶的类别
六、杆状病毒RNA聚合酶与其他RNA聚合酶的关系
七、体外转录实验
八、早期和晚期mRNA的终止和聚腺苷化
九、极晚期基因的表达
十、其他参与晚期转录的基因
参考文献
第七章 杆状病毒感染:细胞周期与凋亡
一、杆状病毒感染和细胞周期
二、病毒合成途径:一个“伪”S期或“病毒”S期环境的诱导
三、细胞凋亡和杆状病毒感染
四、AcMNPV的orf92(p33),细胞凋亡和细胞周期之间的关联?
参考文献
第八章 宿主抗性、易感性以及病毒感染对宿主分子生物学的影响
一、昆虫免疫系统:血细胞、黑化反应和包囊作用
二、宿主细胞对杆状病毒感染的反应:来自蛋白质组学、芯片及表达分析的证据
三、调节病毒感染的其他途径
四、宿主中肠对杆状病毒感染的抗性
五、影响杆状病毒宿主范围的其他因素
六、BmNPV和AcMNPV在家蚕和草地贪夜蛾细胞中宿主范围的调查
七、全体蛋白质(global protein)合成关闭
八、细胞凋亡和杆状病毒感染的特异性
参考文献
第九章 杆状病毒作为杀虫剂
一、感染梨豆毛虫(Anticarsia gemmatalis)的一种NPV:在巴西的应用——一个大挫折.
二、感染苹果蠹蛾(Cydia pomonella)的一种颗粒体病毒:在北美和欧洲的应用
三、感染棉铃虫(Helicoverpa armigera)的一种NPV:在中国的应用
参考文献
第十章 杆状病毒表达技术:原理与应用
一、一些历史
二、启动感染:环境的稳定性和昆虫中肠
三、双相复制周期的进化允许(病毒)开发利用昆虫系统的生物合成能力
四、优化细胞内环境:病毒的RNA聚合酶以及感染晚期大部分病毒和宿主基因的关闭
五、极晚期基因(p10和多角体蛋白基因)的激活和转录
六、基因拷贝数和未包进衣壳的病毒DNA的作用
七、杆状病毒基因表达和生物技术
八、总结和结论
九、杆状病毒表达技术的应用
十、杆状病毒表达蛋白质的翻译后加工
参考文献
第十一章 杆状病毒、逆转录病毒、DNA转座子(piggyBac)和昆虫细胞
一、与杆状病毒相关的游移病毒(逆转录病毒)
二、鳞翅目昆虫中的游移病毒
三、昆虫逆转录病毒和杆状病毒之间的联系:env基因
四、杆状病毒的F蛋白/(游移病毒的env蛋白)的细胞内同源物
五、杆状病毒的F蛋白和昆虫逆转录病毒的env蛋白的特点
六、昆虫逆转录病毒和杆状病毒的其他关系
七、游移病毒具有感染性吗?
八、env是否在游移病毒传染中发挥作用?
九、逆转录因子的入侵和扩增
十、是什么阻止逆转录因子不断扩增?
十一、DNA和组蛋白甲基化对转座元件的抑制
十二、通过RNA干扰抑制转座元件
十三、Argonautes蛋白:具有RNA酶活性的蛋白质,并且对RNA干扰非常重要
十四、性腺细胞中转座元件的抑制
十五、在果蝇中,flamenco是piRNA的一种来源
十六、杆状病毒感染过程中内源性逆转录因子序列的激活
十七、piggyBac,来自粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)的转座子,最初从杆状病毒分离而来
参考文献
第十二章 AcMNPV基因组:基因含量、保守性和功能
一、AcMNPV基因组数据的调整:大约存在150个开放阅读框
二、AcMNPV基因组注释
参考文献
第十三章 与AcMNPV基因组不同源的部分杆状病毒基因:保守性和功能
参考文献
第十四章 专业词汇
参考文献
第十五章 附录
附录1 NcBI数据库中已测序的杆状病毒基因组列表
附录2 基因组已被测序杆状病毒的昆虫宿主名称

前言/序言


病毒学前沿:结构、复制与致病机制 导言 病毒,作为一类独特的、非细胞性的生命实体,其生命活动的复杂性与多样性一直是生命科学领域研究的核心焦点。它们在宿主细胞内劫持分子机器以实现自身复制,这一过程不仅揭示了生命体最基本的相互作用规律,也深刻影响了人类健康与生态平衡。本书《病毒学前沿:结构、复制与致病机制》旨在系统梳理当前病毒学研究的最新进展,尤其聚焦于那些在结构生物学、分子遗传学和疾病研究中具有里程碑意义的病毒家族。本书不涉及特定杆状病毒属(如核多角体蛋白基因家族等)的深入分子机制,而是以更广阔的视角,探讨病毒生命周期中普遍存在或在重要模型病毒中得到验证的核心原理。 第一部分:病毒的结构与分类学 第一章:病毒结构的多样性与自组装 病毒粒子(Virion)的结构是其感染活性的基础。本章将深入探讨病毒外壳(Capsid)的构建原理。我们将分析不同对称性(如二十面体对称、螺旋对称、复杂结构)的形成机制,重点解析病毒衣壳蛋白如何通过高阶的分子识别和自发组装过程,精确地构筑纳米尺度的蛋白质结构。我们将通过冷冻电镜(Cryo-EM)技术解析的三维结构实例,展示衣壳蛋白亚基间的相互作用模式,以及它们如何包裹和保护遗传物质。此外,对病毒包膜(Envelope)的形成,即病毒如何从宿主细胞膜获取脂质层并整合病毒表面蛋白(如刺突蛋白、融合蛋白),也将进行详细阐述。 第二章:病毒基因组的化学多样性与包装 病毒遗传物质的形态极其多样,涵盖了从单链环状DNA到分段负链RNA等所有可能的核酸类型。本章将分类讨论不同基因组的结构特征、复制策略的差异,以及它们如何编码病毒所需的少量功能蛋白。特别地,我们将探讨核酸包装过程中的挑战——如何在有限的空间内高效、准确地装载基因组。这包括对某些病毒(如噬菌体T4)中核酸包装机器(如头蛋白和装载酶)的结构与功能分析。 第三章:现代病毒分类与系统发生学 本章将介绍当前国际病毒分类学委员会(ICTV)的最新分类框架。我们将探讨基于核酸序列和进化关系构建的系统发生树,如何帮助我们理解病毒间的趋同进化和跨物种传播(Zoonosis)。我们将聚焦于病毒的“界(Realm)”、“目(Order)”、“科(Family)”等不同分类层级所依据的分子证据,并讨论如何利用生物信息学工具重建病毒的分子钟和进化速率。 第二部分:病毒复制的分子机制 第四章:宿主细胞识别与进入机制 病毒感染的第一步是精确识别宿主细胞。本章将详细解析病毒表面受体结合蛋白(如配体)与宿主细胞表面受体(如糖蛋白、整合素或特异性膜蛋白)之间的分子对接过程。我们将对比不同病毒(如流感病毒、腺病毒、HIV)如何利用内吞作用、膜融合或直接穿透等方式进入细胞内部。对膜融合机制的探讨将着重于融合前肽和融合核心的构象变化,这是实现病毒膜与细胞膜融合的关键步骤。 第五章:核酸复制与转录的策略 病毒的基因组复制策略是其生命周期中最具决定性的环节。本章将系统梳理DNA病毒(依赖或不依赖宿主聚合酶)、RNA病毒(包括正链、负链及双链RNA)以及逆转录病毒的复制模式。对RNA病毒的讨论将深入到RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)的结构域功能,以及它们在复制过程中如何应对高突变率的挑战。对于需要进入细胞核的病毒,其核定位信号(NLS)与核孔复合体的相互作用机制也将被详细剖析。 第六章:蛋白质的合成与修饰 病毒蛋白质的表达效率直接决定了病毒粒子的产量。本章将讨论病毒如何操纵宿主细胞的核糖体、tRNA库以及翻译起始与终止机制。我们将分析某些病毒(如逆转录病毒的移码机制、某些RNA病毒的亚基因组RNA表达策略)为在有限的基因组空间内最大化蛋白质产量而采用的“基因组稀释”技巧。此外,对病毒蛋白在内质网和高尔基体中进行的翻译后修饰(如糖基化、磷酸化)及其对病毒成熟和释放的影响也将被纳入讨论范围。 第七章:病毒组装与释放 病毒颗粒的成熟过程是高度有序的分子装配序列。本章将探讨病毒装配的驱动力——熵增与亲和力平衡。我们将区分“成熟”与“出芽”两种主要的释放方式。对于出芽病毒,如冠状病毒或乙型肝炎病毒,其包膜蛋白如何定向导向特定的细胞膜区域,以及核衣壳如何通过穿过这层膜完成装配与释放,是本章的重点。同时,对裂解性释放(如某些噬菌体)中溶菌酶的作用机制也将进行分析。 第三部分:病毒与宿主的相互作用 第八章:抗病毒先天免疫的分子对抗 宿主细胞的先天免疫系统是抵御病毒感染的第一道防线。本章将重点解析模式识别受体(PRRs),如RIG-I、MDA5和Toll样受体(TLRs),如何识别病毒核酸分子(PAMPs)。随后,我们将深入探讨信号转导通路(如MAVS、IRF3/7激活),以及最终诱导产生I型干扰素(IFN)的分子级联反应。 第九章:病毒逃逸免疫应答的策略 为确保自身的复制成功,病毒进化出了一系列精妙的机制来规避或抑制宿主的抗病毒反应。本章将详细描述病毒蛋白如何靶向和降解关键的信号分子(如蛋白酶降解RIG-I信号通路组分),或直接干扰IFN的表达、分泌及其下游效应分子(如JAK-STAT通路)的活性。 第十章:病毒致病性的分子基础 病毒感染如何从一个单纯的细胞事件转变为一个组织或器官层面的疾病?本章将从分子病理学的角度探讨这一转化。我们将讨论病毒蛋白如何诱导细胞凋亡、促进细胞周期阻滞,或通过分子模拟(Molecular Mimicry)引发自身免疫反应。对某些重要病原体引发的慢性感染或潜伏期维持的分子基础也将予以介绍,但研究重点将放在一般性的机制而非特异性的病毒家族效应上。 结论 本书在提供坚实理论框架的同时,强调了现代病毒学研究依赖的先进技术,如高分辨率冷冻电镜、CRISPR/Cas9等基因编辑技术在病毒学中的应用,以及基于计算模型的病毒动力学模拟。通过对病毒生命周期中结构、遗传和相互作用的全面梳理,本书为病毒学、微生物学及相关生物医学领域的研究人员和学生提供了一份深入且前沿的参考资料。

用户评价

评分

这本书的价值在于它对杆状病毒在生物技术和医药领域的应用进行了非常全面且深入的阐述,为相关领域的研究人员提供了宝贵的参考。在生物表达系统方面,作者对利用杆状病毒作为高效的基因递送载体进行了详尽的介绍,包括其构建策略、表达效率以及在细胞和组织培养中的应用。我特别关注了书中关于利用杆状病毒生产疫苗、治疗性蛋白以及诊断试剂的案例,这些应用不仅展示了杆状病毒的巨大潜力,也为我们理解如何将基础研究成果转化为实际应用提供了清晰的思路。书中对杆状病毒作为基因治疗载体的可能性也进行了探讨,虽然目前还处于早期阶段,但其前景令人振奋。此外,作者还对杆状病毒在昆虫诱捕剂和基因工程昆虫等方面的应用进行了介绍,这些都进一步凸显了杆状病毒的多功能性。这本书的讨论不仅限于当前的应用,更展望了未来杆状病毒研究和应用的发展趋势,极具前瞻性。

评分

这本书简直是一场知识的盛宴,打开第一页就感觉自己仿佛置身于一个充满活力的分子世界。作者在介绍杆状病毒的结构和复制周期时,运用了极其生动形象的比喻,将那些抽象的基因表达和蛋白质组装过程描绘得如同戏剧般引人入胜。我特别欣赏他对于不同宿主细胞与杆状病毒相互作用的深入剖析,那些细节的描述,比如病毒如何巧妙地绕过宿主的免疫防御,以及如何精确地调控自身的基因表达来最大化复制效率,都让我大开眼界。更令人称道的是,书中不仅仅停留在理论层面,还穿插了大量引人入胜的实验案例,这些案例不仅仅是枯燥的数据堆砌,而是通过清晰的逻辑链条,展示了科学家们是如何一步步揭开杆状病毒神秘面纱的过程。读到关于杆状病毒在昆虫细胞中大规模生产重组蛋白的部分,我更是跃跃欲试,仿佛已经看到了利用这些强大的工具创造出新型药物和疫苗的广阔前景。这本书的语言流畅自然,即便是一些复杂的概念,在作者的解读下也变得易于理解,让我这个非专业背景的读者也能充分体会到其中蕴含的科学魅力。

评分

这本书简直就是一本为初学者量身打造的入门指南,如果你对杆状病毒这一神奇的生物体感到好奇,那么这本书绝对是你最好的起点。作者从最基础的概念讲起,循序渐进地介绍了杆状病毒的分类、基本形态以及它们在自然界中的分布。在讲解病毒的感染过程时,作者运用了大量生动的插图和流程图,将复杂的细胞内事件,比如病毒吸附、内吞、基因组释放以及核酸复制,变得一目了然。我特别喜欢书中关于杆状病毒作为生物防治工具的介绍,那些关于如何利用它们来控制农业害虫的案例,不仅有趣,而且极具实用价值,让我看到了科学如何能够为解决现实问题提供有效的解决方案。书中还涉及到一些基础的分子生物学技术,例如PCR、凝胶电泳等,对于想要了解杆状病毒研究方法但又缺乏相关背景的读者来说,这些内容非常具有启发性。总的来说,这本书以一种非常友好的方式,将一个看似复杂的科学领域展现出来,让我对杆状病毒产生了浓厚的兴趣。

评分

作为一名长期在病毒学领域摸爬滚打的研究人员,我一直希望能找到一本能够系统梳理杆状病毒最新研究进展的著作,而这本书恰恰满足了我的需求。它在基因组学和蛋白质组学层面进行的深入探讨,为理解杆状病毒的进化和多样性提供了全新的视角。我尤其对其中关于病毒-宿主互作网络的研究感到印象深刻,作者详细阐述了如何利用高通量测序技术和生物信息学工具来绘制这些复杂的相互作用图谱,这对于揭示病毒感染的分子机制至关重要。书中对于CRISPR-Cas系统的应用也进行了精彩的介绍,展示了这一强大基因编辑技术在杆状病毒研究中的巨大潜力,包括靶向突变、基因敲除以及构建新型病毒载体等。我反复研读了关于病毒致病性和宿主免疫应答的章节,作者对于宿主细胞内固有免疫和适应性免疫如何响应杆状病毒感染的论述,结合了最新的研究成果,提供了非常前沿的见解。这本书的参考文献列表非常详实,为我后续的深入研究提供了宝贵的线索。

评分

这本书的视角非常独特,它不仅仅局限于杆状病毒本身的生物学特性,更将其置于更宏观的生态和进化背景下进行考察,这种跨学科的融合让我耳目一新。作者在探讨杆状病毒的起源和进化时,引用了大量的古DNA证据和系统发生学分析,揭示了杆状病毒在漫长演化过程中如何与宿主共同进化的精妙故事。我尤其赞赏书中关于病毒变异和适应性的章节,作者详细阐述了杆状病毒如何通过基因重组、点突变等方式快速适应环境变化和宿主免疫压力,这对于理解病毒的传播动态和产生耐药性至关重要。书中对杆状病毒基因组结构及其调控元件的深入分析,也为我们理解其高度的基因表达调控网络提供了坚实的基础。读到关于杆状病毒与共生微生物相互作用的部分,我更是惊喜连连,这让我意识到病毒并非孤立存在,而是与其他生物体形成复杂生态网络的一部分。这本书的论述严谨而富有启发性,极大地拓展了我对病毒生物学的认知边界。

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