內容簡介
結閤國內外文獻報道,《雞脂肪組織生長發育的分子遺傳學基礎》係統介紹瞭東北農業大學傢禽課題組在雞脂肪組織生長發育的分子遺傳學基礎領域內的研究進展。《雞脂肪組織生長發育的分子遺傳學基礎》共 16 章,主要內容包括:肉雞資源群體的建立,雞脂肪組織的發育生物學研究,雞生長與腹脂性狀的 QTL 定位研究,雞脂肪性狀的全基因組關聯分析、選擇信號檢測及拷貝數變異分析,基因間互作效應對肉雞腹脂性狀的影響,雞脂肪組織生長發育相關重要基因和蛋白質的篩選,重要候選基因與雞體脂性狀的相關研究,雞脂肪細胞的培養,雞 A-FABP、PPARγ、C/EBPα、SREBP1、KLF 等基因的功能研究,雞脂肪組織生長發育的錶觀遺傳學研究,雞脂肪組織生長發育的分子遺傳學基礎研究展望。內容既涉及經典的體脂性狀QTL 定位、候選基因關聯分析和分子遺傳學研究的理論、方法與研究結果,又涵蓋瞭近年來的研究熱點,包括全基因組關聯分析、選擇信號檢測、拷貝數變異分析的理論、方法與研究結果。同時《雞脂肪組織生長發育的分子遺傳學基礎》著重闡述瞭對多個影響雞脂肪組織生長發育重要基因功能的研究結果。
目錄
目錄
前言
第一章 肉雞資源群體的建立 1
第一節 東北農業大學肉雞腹脂雙嚮選擇品係 1
一、概述 1
二、控製雞體內脂肪沉積的研究進展 1
三、東北農業大學肉雞高、低腹脂雙嚮選擇品係 5
四、高、低脂係肉雞肌肉、肝髒脂肪含量的比較 7
五、高、低脂係肉雞血脂生化指標的比較分析 9
第二節 東北農業大學F2 資源群體 15
一、概述 15
二、東北農業大學F2 資源群體的基本信息 16
參考文獻 18
第二章 雞脂肪組織的發育生物學研究 24
第一節 脂肪組織的起源和形成 24
一、脂肪組織的起源 24
二、脂肪組織的形成 26
三、不同部位脂肪組織的異質性 27
四、同一部位脂肪組織的潛在異質性 29
第二節 脂肪組織的功能和分布 29
一、脂肪組織功能概述 29
二、脂肪組織的分布特點 30
三、白色脂肪組織和棕色脂肪組織 31
第三節 高、低脂係肉雞腹部脂肪組織的組織學觀察與分析 32
一、高、低脂係肉雞體重、腹脂重及腹脂率的比較 33
二、高、低脂係肉雞腹部脂肪組織的組織學差異 33
三、高、低脂係肉雞腹部脂肪組織中總細胞數量的比較 38
四、高、低脂係肉雞腹部脂肪組織細胞增殖能力的比較 38
參考文獻 40
第三章 雞生長與腹脂性狀的QTL 定位研究 46
第一節 雞生長和腹脂性狀QTL 的初步定位 47
一、微衛星標記參數及傢係遺傳結構分析 47
二、遺傳連鎖圖譜的構建 48
三、影響雞體重和腹脂性狀QTL 的初步定位 50
第二節 雞體重和腹脂性狀QTL 的精細定位 58
一、增加標記密度精細定位影響雞體重和腹脂性狀的QTL 58
二、擴大檢測群體規模精細定位影響雞體重和腹脂性狀的QTL 61
三、進一步擴大檢測群體規模精細定位影響雞體重和腹脂性狀的QTL 63
四、單倍型分析精細定位影響雞體重的QTL 70
參考文獻 76
第四章 雞脂肪性狀的全基因組關聯分析、選擇信號檢測及拷貝數變異分析 79
第一節 雞脂肪性狀全基因組關聯分析研究 79
一、全基因組關聯分析研究的概念 79
二、全基因組關聯研究效應的估計方法 79
三、雞重要性狀的全基因組關聯研究進展 80
四、高、低脂係肉雞腹脂性狀全基因組關聯分析研究 81
第二節 高、低脂係肉雞選擇信號分析 85
一、選擇信號的概念 85
二、選擇信號的檢測方法 86
三、雞全基因組選擇信號分析研究進展 87
四、高、低脂係肉雞選擇信號的檢測 87
第三節 高、低脂係肉雞拷貝數變異分析 101
一、拷貝數變異的概念 101
二、拷貝數變異的檢測方法 101
三、雞拷貝數變異的研究進展 102
四、高、低脂係肉雞拷貝數變異的檢測 102
參考文獻 107
第五章基因間互作效應對肉雞腹脂性狀的影響 112
第一節基因互作效應簡介 112
一、互作效應的概念 112
二、檢測互作效應的統計方法 112
第二節 候選基因互作效應研究 114
一、基因互作效應對畜禽復雜性狀遺傳學影響的研究進展 114
二、候選基因多態性位點間互作效應對肉雞腹脂性狀的影響 116
第三節 全基因組SNP 互作效應對肉雞腹脂性狀的影響 137
一、檢測全基因組SNP 互作效應的統計方法 137
二、SNP-SNP 網絡的相關研究進展 142
三、全基因組範圍內SNP 互作效應對肉雞腹脂性狀的影響 143
參考文獻 157
第六章 雞脂肪生長發育相關重要基因和蛋白質的篩選 166
第一節 雞脂質代謝的特點 166
一、脂肪酸的閤成及運輸 166
二、脂肪的閤成、運輸及分解 167
三、脂肪的沉積 168
第二節 雞脂肪生長發育相關重要基因的篩選 169
一、肉雞和蛋雞間脂肪和肝髒組織差異錶達基因的篩選 170
二、高、低脂係肉雞脂肪和肝髒組織差異錶達基因的篩選 173
第三節 雞脂肪生長發育相關重要蛋白質的篩選 182
參考文獻 189
第七章 重要候選基因與雞體脂性狀的相關研究 194
第一節 動物分子育種概述 194
一、標記輔助選擇介紹 195
二、影響標記輔助選擇效率的因素 195
三、影響畜禽肉質性狀的基因或分子標記的研究進展 197
四、標記輔助選擇的應用 197
第二節 雞肌肉生長抑製素(Myostatin)基因多態性與體脂性狀的相關研究 198
一、Myostatin基因單核苷酸多態性的檢測 199
二、不同品種(係)雞Myostatin SNP基因型和等位基因頻率分布 200
三、Myostatin基因單核苷酸多態性與體脂性狀的相關研究 202
第三節 雞解偶聯蛋白(UCP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 203
一、UCP基因多態性的檢測 203
二、不同品種(係)中UCP基因SNP 等位基因和基因型頻率分布 204
三、雞UCP基因多態性與屠體性狀的相關分析 205
第四節 雞瘦蛋白受體(OBR)基因多態性與體脂性狀的相關研究 208
一、OBR基因單核苷酸多態性的檢測 209
二、不同品種(係)OBR基因外顯子9 的c.8187 C>A 突變位點基因型和等位基因頻率比較 210
三、OBR基因單核苷酸多態性與體脂性狀的相關研究 210
第五節 雞胰島素樣生長因子2(IGF2)基因多態性與體脂性狀的相關研究 212
一、IGF2基因多態性檢測 212
二、雞IGF2 突變位點在不同品種(係)中等位基因頻率和基因型頻率分布 213
三、IGF2基因單核苷酸多態性與雞體脂性狀的相關分析 213
第六節 雞脂肪酸結閤蛋白(FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 214
一、雞脂肪型脂肪酸結閤蛋白(A-FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 215
二、雞心髒型脂肪酸結閤蛋白(H-FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 221
三、雞腸型脂肪酸結閤蛋白(I-FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 224
四、雞肝髒型脂肪酸結閤蛋白(L-FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 226
五、雞肝髒基礎型脂肪酸結閤蛋白(Lb-FABP)基因多態性與體脂性狀的相關研究 229
第七節 雞黑素皮質素受體4(MC4R)基因多態性與體脂性狀的相關研究 232
一、雞MC4R基因多態性檢測 232
二、突變位點多態性與生長性狀的相關分析 233
第八節 雞蘋果酸脫氫酶(MD)基因多態性與體脂性狀的相關研究 235
一、雞MD基因單核苷酸多態性檢測及基因型分析 235
二、MD基因單核苷酸多態性與雞體脂性狀的相關分析 236
第九節 雞載脂蛋白B(ApoB)基因多態性與體脂性狀的相關研究 237
一、雞ApoB基因多態性檢測 237
二、雞ApoB基因多態性與體脂性狀的相關分析 239
第十節 雞類胰島素生長因子結閤蛋白2(IGFBP2)基因多態性與體重和腹脂性狀的相關研究 241
一、IGFBP2基因多態性檢測 241
二、不同品種(係)雞IGFBP2基因g.1196 C>A 等位基因和基因型頻率分布 242
三、IGFBP2基因多態性與肉雞生長和屠體性狀的相關分析 242
第十一節 雞甲狀腺激素應答蛋白(Spot14α)基因多態性與體重性狀的相關研究 245
一、雞Spot14α基因多態性檢測及基因型分析 245
二、雞Spot14α基因多態性與體重性狀的相關分析 247
三、Spot14α基因在東農F2 群體中的單倍型分析 249
第十二節 雞胰島素樣生長因子1(IGF1)基因及其受體(IGF1R)基因多態性與體脂性狀的相關研究 251
一、雞IGF1、IGF1R基因多態性檢測 251
二、雞IGF1、IGF1R基因多態性與體脂性狀的相關分析 252
第十三節 雞乙酰輔酶A 羧化酶α(ACCα)基因與體脂性狀的相關研究 255
一、雞ACCα基因多態性檢測和基因分型 256
二、雞ACCα基因多態性與體脂性狀的相關分析 256
第十四節 雞過氧化物酶體增殖劑激活受體γ(PPARγ)基因多態性與體脂性狀的相關研究 258
一、雞PPARγ基因多態性檢測 258
二、單倍型構建及連鎖不平衡程度分析 259
三、PPARγ基因單倍型多態性與雞生長和體組成性狀的相關分析 260
第十五節 雞CCAAT 增強子結閤蛋白α(C/EBPα)基因多態性與體脂性狀的相關研究 260
一、雞C/EBPα基因序列分析及多態性檢測 261
二、C/EBPα基因多態性與雞體脂性狀的相關分析 262
第十六節 雞視網膜母細胞瘤基因1(RB1)基因多態性與體重性狀的相關研究 263
一、SNP 分型結果 264
二、單位點SNP 與雞體重的相關分析 264
三、單倍型與雞體重的相關分析 267
第十七節 雞脂肪酸閤成酶(FAS)基因多態性與體脂性狀的相關研究 269
一、FAS基因多態性檢測 269
二、雞FAS基因與體脂性狀的相關分析 270
第十八節 雞腹脂性狀重要基因功能性SNP 鑒定研究 271
一、雞載脂蛋白AⅠ(Apo-AⅠ)基因功能性SNP 的鑒定與分析 271
二、雞類胰島素生長因子結閤蛋白2(IGFBP2)基因功能性SNP 的鑒定與分析 274
參考文獻 278
第八章 雞脂肪細胞的培養 291
第一節 脂肪細胞的來源、分布、結構和功能 291
一、脂肪細胞的來源 291
二、脂肪細胞的分布 292
三、脂肪細胞的結構 293
四、脂肪細胞的功能 293
第二節 雞脂肪細胞的離體培養 294
一、前脂肪細胞的培養模式及其特點 294
二、前脂肪細胞的增殖與分化 297
第三節 油酸對雞原代細胞的誘導分化作用 308
一、油酸誘導雞成縴維細胞轉分化為脂肪樣細胞 308
二、油酸誘導雞前脂肪細胞分化為脂肪細胞 311
參考文獻 315
第九章 雞脂肪型脂肪酸結閤蛋白(A-FABP)的功能研究 323
第一節 雞A-FABP基因的時空錶達規律分析 324
一、雞A-FABP基因的剋隆與序列分析 324
二、雞A-FABP基因在不同組織中的錶達分析 324
三、雞A-FABP基因在高、低脂係肉雞脂肪組織中的錶達差異分析 325
第二節 雞A-FABP基因在脂類代謝中的功能研究 327
一、雞A-FABP在“前脂肪細胞—誘導—轉染”過程中的功能研究 327
二、雞A-FABP在“前脂肪細胞—轉染—誘導”過程中的功能研究 333
三、前脂肪細胞中雞A-FABP的功能研究 337
參考文獻 341
第十章 其他脂肪酸結閤蛋白傢族基因的功能研究 345
第一節 雞H-FABP基因 346
一、雞H-FABP基因的剋隆與序列分析 346
二、雞H-FABP基因的時空錶達規律分析 347
第二節 雞I-FABP基因 349
一、雞I-FABP基因的剋隆與序列分析 349
二、雞I-FABP基因的時空錶達規律分析 349
第三節 雞L-FABP
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