前 言 世界夠大，時間夠多
01達爾文進化論的局限
達爾文進化論的局限在於，它無法解釋遺傳現象。生命起源於何處？更好、更強的適者從何而來？大自然如何無中生有，如何創新？達爾文的進化論是人類曆史上傑齣的學術成就，但生物進化的秘密遠不是達爾文進化論所能窮盡的。生物學在20世紀發生瞭翻天覆地的變化，現代技術得以帶領我們探索生命進化的動力和起源。
02新性狀的起源
新性狀的齣現有賴於新的分子和閤成這些新分子的化學反應的存在。生命以及生命背後驅動新性狀齣現的動力並不是神秘莫測的東西，這種動力本身和生命一樣古老。我們還不知道生命到底是如何從最簡單的形式進化齣瞭如此高的復雜性，但我們知道，生命的開端不是一個自我復製的分子，而是一張新陳代謝的網絡。
03宇宙圖書館
一種生物所具有的全部生化反應構成瞭這種生物的新陳代謝。新陳代謝進化的本質在於重新組閤。生命時刻在嘗試每一種可能的基因新組閤，重新解讀，重新編譯，然後重新布局代謝遺傳，毫不停歇，從而造就並提升著代謝的多樣性。新的代謝能力是不斷驅動生命拓展最前沿陣地的引擎。
04構型之美
蛋白質是生命的驅動者。每種蛋白質的構型都高度復雜，與它們執行的功能相適應。蛋白質的構型維持著生命世界的運轉。大自然可以用蛋白質書寫不同的文本，更多的文本就意味著更多的構型，參與更多的催化反應，執行更多的功能和完成更多的任務。
05命令與操控
無論多復雜的生物，它的形態和功能都受到調節因子的控製。調節因子占據著某個基因相鄰的一小段DNA，一旦它們遇上特定的DNA序列，就會與之結閤。調節因子與相應的DNA需要在形態上互補。有些基因錶達能被調節因子抑製，有些基因則需要它們激活。調節因子指導著所有生物的發育。調節因子之間相互調控，形成瞭復雜的網絡。
06神秘的建築師
多變的環境催生瞭生物的復雜性，而復雜性促成瞭發育穩態，發育穩態繼而造就瞭基因型網絡，後者讓進化成為可能，使得生物能夠通過演變適應環境的變化、提高自身的復雜性，循環往復，生物進化通過這種方式螺鏇上升。這種進化方式的核心在於處在多維空間的基因型網絡的自組織性。自組織性是生命絢爛光彩背後的支持者，它是隱藏的生命建築師。
07從大自然到工程技術
自然進化和技術創新有諸多共同之處，促進自然進化的基因型網絡在人類技術進步中同樣存在。與自然界類似，科研人員也總是行進在各自領域的最前綫，他們依賴不斷的試錯、
人海戰術、多起源策略和組閤優化，模仿自然的創造能力，實現技術突破和創新。技術發明的精簡主義和高雅主義，深深隱藏在現實世界的背後。
後 記 柏拉圖的洞穴
譯者後記
· · · · · · (收起)
具體描述
“生命科學書係”之一。這是一本關於進化論的書。達爾文的自然選擇理論能很好地解釋瞭適者是如何經過漫長的時間保留瞭下來，但是無法解釋適者究竟是怎麼到來的。僅僅曆經38億年的隨機突變，能解釋翅膀、眼球是怎麼來的嗎？如果答案是“否”的話，該如何解釋進化的速度與效率呢？《適者的到來》這本書，就是作者15年的研究成果，補上瞭達爾文理論缺失的部分，揭開瞭生命多樣性的奧秘。
用戶評價
##從基因型到錶現型是基因組成的環境錶現在生物體上是什麼樣子的，很多看似沒用的基因可能在未來通過變異增加或減少瞭一個生物的適閤度，這是創新的一種方法。 多變的環境塑造瞭發育穩態，發育穩態塑造瞭基因多樣性，基因多樣性締造的基因網絡為物種分流提供瞭可能性（環境-選擇適者-物種），遺傳和變異對一個生物的適應力可以造成影響，適閤環境者就是現在的樣子。適閤環境者本身也是環境的一部分。 發育穩態（robustness）。發育穩態指麵對外界環境時生物體保持自身特徵穩定的能力。 《復雜生命的起源》《生命的躍升》《基因社會》
評分##作者用數學的方法結閤達爾文的進化論研究生物進化，他認為一旦生命的基本原材料到位，生命就會在自組織性下配閤自然選擇自我進化，不管是基因、蛋白質、還是對蛋白質的調控機製，用數學的方法對它們進行分析，就會發現它們本身都蘊含著龐大的信息，而生命的進化無非是在這個超宇宙級彆的圖書館裏尋找著更能讓自己生存下去的道路，這個過程充滿瞭殘酷的淘汰，最終造就瞭能繼續生存的適者，從這個意義上講，人類還遠不是這張生存大網的終點，我們不過是暫時的領先者。
評分##作者用數學的方法結閤達爾文的進化論研究生物進化，他認為一旦生命的基本原材料到位，生命就會在自組織性下配閤自然選擇自我進化，不管是基因、蛋白質、還是對蛋白質的調控機製，用數學的方法對它們進行分析，就會發現它們本身都蘊含著龐大的信息，而生命的進化無非是在這個超宇宙級彆的圖書館裏尋找著更能讓自己生存下去的道路，這個過程充滿瞭殘酷的淘汰，最終造就瞭能繼續生存的適者，從這個意義上講，人類還遠不是這張生存大網的終點，我們不過是暫時的領先者。
評分##很有啓發的一次跨學科科普。
評分##看似講進化論，其實闡述瞭一個普遍的復雜性原理：冗餘應對環境變化（創新）。書中分子生物學和生物化學知識太專業，導緻閱讀門檻很高，但重點是從基因型到錶現型受到復雜的調節因子自組織網絡的作用，看似很多沒用的垃圾基因其實正是應對未來環境變化的保障，即復雜性增加適應力。這是創新的必要條件，與工程學的冗餘管理相通，與投資強調的安全邊際相通。
評分##看似講進化論，其實闡述瞭一個普遍的復雜性原理：冗餘應對環境變化（創新）。書中分子生物學和生物化學知識太專業，導緻閱讀門檻很高，但重點是從基因型到錶現型受到復雜的調節因子自組織網絡的作用，看似很多沒用的垃圾基因其實正是應對未來環境變化的保障，即復雜性增加適應力。這是創新的必要條件，與工程學的冗餘管理相通，與投資強調的安全邊際相通。
評分##多變的環境塑造瞭發育穩態，發育穩態又塑造瞭基因多樣性，基因多樣性締造的基因型網絡為進化提供豐富的資源，從而促成瞭進化的高效性。
評分##結構上跟達爾文黑匣子正好相反，這本上來先下結論（很委婉，隻是說達爾文進化論沒法解釋物種起源），後麵每章都通過對微觀的細胞生化作用來反駁進化論（進化論到微觀世界就解釋不瞭）。這書剛開始時那些類比還是挺有意思的，但是後麵每介紹個工作狀況、實驗設計都要把同事搬齣來然後贊美一番，有些奇怪；另外就是這本沒有達爾文的黑匣子寫的那麼深刻，沒有揭示反駁進化論帶來的深層次意義（感覺到作者小心謹慎，畢竟現在進化論是主流）
評分##按需。
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