新一代测序数据分析

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[美] 王忻琨 著,陈浩峰,主 译
图书标签:
  • NGS
  • 基因组学
  • 生物信息学
  • 测序分析
  • 数据挖掘
  • Python
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  • 生物统计学
  • 基因表达
  • 变异分析
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出版社: 科学出版社
ISBN:9787030564696
版次:31
商品编码:12316960
包装:平装
丛书名: 新生物学丛书
开本:32开
出版时间:2018-02-01
页数:212
正文语种:中文

具体描述

内容简介

  本书是一部介绍有关新一代测序(NGS)数据分析方法的著作。书中全面系统地介绍了新—代测序技术的生物学意义、测序原理、分析过程和应用领域等;详细介绍了新—代测序数据的分析方法,包括其在基因组从头测序和重测序、转录组测序、小RNA测序、ChIP测序、表观基因组测序及宏基因组测序等应用中的具体分析方法,对读者学习新一代测序技术、促进该技术在生命科学各个领域中的应用有着重要意义。
《古籍修复与保护技术前沿》 图书简介 引言:传承的重任与现代科技的交汇 古籍,承载着人类文明的记忆与智慧的结晶,是连接过去与未来的重要桥梁。随着时间的流逝,纸张的脆化、墨色的褪变、虫蛀霉变的威胁,无时无刻不在考验着这些珍贵文物的留存。本书《古籍修复与保护技术前沿》旨在系统梳理和深入探讨当代古籍保护修复领域的核心理念、关键技术以及未来发展趋势。本书并非侧重于前沿的生物信息学或高通量测序数据处理,而是将焦点完全聚焦于传统文化遗产的物质实体保护与科学修复实践。 第一部分:古籍病害的诊断与基础认知 本部分详尽阐述了影响古籍寿命的各种主要因素及其机理。 1.1 纸张的化学老化与物理损伤: 深入分析了纤维素、半纤维素和木质素的降解过程,探讨了酸性残留物(如硫酸盐、硝酸盐)对纸张pH值的影响及其导致的脆化现象。我们详细描述了霉菌、细菌等生物侵害的形态特征、扩散路径及其对纤维结构的破坏机制。 1.2 墨、颜料与翚纸的稳定性评估: 考察了不同历史时期使用的主要墨料(如松烟墨、油烟墨)和矿物、植物颜料在光照、湿度变化下的色变与附着力变化。探讨了不同装帧材料(绫罗、麻纸)的物理特性与保存环境的相互作用。 1.3 数字化成像技术在病害诊断中的应用(非测序数据): 本章重点介绍高光谱成像(Hyperspectral Imaging)、多光谱成像(Multispectral Imaging)和X射线荧光分析(XRF)等非侵入性技术,如何用于无损地识别纸张的成分分布、墨层厚度及早期病害的隐性区域,为后续的修复决策提供科学依据。 第二部分:现代修复材料的科学选择与应用 古籍修复的成败,很大程度上取决于所用修复材料的稳定性、相容性与可逆性。本部分严格遵循“最小干预”和“可逆性”的修复伦理。 2.1 纤维基修复材料的研发与筛选: 详细对比了传统的手工宣纸、皮纸与现代高纯度、低酸性、高稳定性的博物馆级修复用纸(如日本雁皮纸、桑皮纸的改良品种)。讨论了通过控制纤维长度、结晶度和表面处理来优化修复纸的机械强度和吸湿性能。 2.2 粘合剂的科学配方与优化: 剖析了传统动物胶(如鱼鳔胶、牛皮胶)的制备工艺优化,并重点介绍了合成高分子材料(如羟丙基纤维素 HPMC、聚乙烯醇 PVA)在特定修复场景下的应用边界、浓度控制及其长期老化测试标准。强调了粘合剂在固化过程中对被修复对象的应力控制。 2.3 增固与加固技术的比较研究: 探讨了针对严重粉化、脆弱化文物的纳米级材料渗透加固技术,如使用特定纳米级的碳酸钙或硅酸盐溶液进行微孔填充,以恢复纸张的结构完整性,同时保持其透气性和触感。 第三部分:关键修复工艺的流程化与标准化 本部分提供了从基础处理到复杂修复的详细操作指南,强调工艺的精确性与可重复性。 3.1 去污、除酸与熏蒸处理: 阐述了针对水渍、霉斑、油污的针对性去污方法。重点介绍了超临界二氧化碳(Sc-CO2)在不溶于水或酒精的文物上的应用,以及使用弱碱性缓冲剂进行无水除酸的流程设计,确保对文物本体的化学影响降至最低。 3.2 托裱技术与页面修复的精细化操作: 详细讲解了针对不同破损程度的书页进行“衬垫”、“补洞”、“拼贴”的技术要点。引入了恒温恒湿环境下的页面平展技术,避免修复后的收缩或起皱,并讨论了如何使用特制工具精确控制修补材料与原书页纤维的“纤维对齐”。 3.3 传统装帧的复原与加固: 涵盖了线装书、册页、经折装等不同装帧形式的恢复。重点介绍了如何在不改变原有形制的基础上,对书脊、线绳和封面进行结构性加固,延长其使用寿命。 第四部分:保存环境控制与长期监测体系 修复后的保护工作与环境控制同等重要。本部分关注如何建立一个稳定的、适宜古籍生存的微环境。 4.1 典藏库房的温湿度调控标准: 明确了不同类型(如宋元善本、清末民初期刊)古籍对相对湿度(RH)和温度的适宜范围及季节性波动容忍度。讨论了HVAC(暖通空调)系统在保持环境均匀性方面的设计要点。 4.2 光照防护与辐射控制: 分析了可见光、紫外线和红外线对古籍色素和纤维的累积损伤效应。提供了安全照明(如LED冷光源)的选择标准、光照强度(勒克斯 Lux)的监测规范,以及库房遮光材料的选择。 4.3 灾害预防与应急响应预案: 建立了火灾、水患、虫害爆发等突发事件的快速响应流程(SOP),包括应急抢救打包、初步干燥、隔离存储等环节的专业操作指南。 结语:修复伦理与未来展望 本书的最终目标是培养修复师的科学思维与严谨的职业操守。修复不再仅仅是匠人的技艺,而是建立在材料科学、化学分析和文物保护学基础上的系统工程。未来的发展将更侧重于非侵入性修复、智能化环境监测以及修复材料的生物降解性和可持续性研究。 本书特色: 实践导向: 包含大量详细的实验数据、材料对比图表和修复案例分析。 跨学科融合: 汇集了材料科学、化学分析和传统工艺的最新研究成果。 标准参照: 严格参照国际文物保护组织(如ICCROM)及国内行业标准,确保技术的科学性和权威性。 适合读者: 图书馆、博物馆、档案馆的专业修复人员、文物保护专业的师生、古籍收藏爱好者以及从事档案管理和历史文献研究的专业人士。

用户评价

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坦率地说,这本书的深度和广度令人印象深刻,尤其是在处理复杂生物学数据时展现出的技术细节,绝对是专业人士的案头必备。我最初是抱着一种希望了解大数据可视化在非生物信息学领域应用的期待来翻阅的,比如如何用先进的算法来揭示城市交通流的隐藏模式,或者如何构建一个多维度的金融风险评估模型的可视化界面。然而,书中绝大多数的案例和方法论都紧密围绕着高通量测序数据的处理流程展开,无论是比对算法的优化,还是差异表达基因的统计显著性检验,都显得异常专业和聚焦。这就像一个专为航天工程师准备的导航手册,里面充满了关于轨道力学和推进剂配方的精妙计算,但对于一个研究空间艺术装置设计的艺术家来说,虽然能感受到其中的严谨,却难以找到直接可以借鉴的灵感或工具。我希望能看到一些关于如何将这些强大的计算范式迁移到其他数据密集型领域,比如社交网络分析或者环境污染监测的实例。

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这本书的装帧设计真是太吸引人了,封面那种深邃的蓝色调,配上简洁有力的白色字体,一下子就抓住了我的眼球。刚拿到手的时候,我还挺期待里面能有一些关于古代文献修复与数字化保存的前沿技术介绍,毕竟现在很多珍贵的历史资料都面临着物理损坏的风险,数字化无疑是最好的保护方式。我翻阅了一些章节的标题,发现很多似乎都集中在基因组学这个领域,虽然这方面也很重要,但对我这个主要关注历史文献保护与信息检索的读者来说,直接相关的内容可能不多。我本来希望看到一些关于高分辨率扫描仪的选择标准、OCR技术在古籍识别中的挑战与解决方案,或者甚至是利用区块链技术来确保证本数字副本的真实性和不可篡改性等内容。这本书如果能拓展一些跨学科的视野,比如将现代信息管理理论应用到历史档案馆的建设中,那会更符合我的预期。它的排版和纸张质量毋庸置疑是顶级的,拿在手里阅读体验极佳,但内容上的侧重点似乎与我期待的“信息技术如何赋能人文社科领域”这个大方向有些偏差。

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从技术文档的角度来看,这本书的参考价值是无可替代的,它详尽地列举了各种工具包和编程脚本的使用方法,对于想要快速上手的从业者来说,简直是一份宝典。我最近在为一个大型城市规划项目设计一套动态的人口流动预测系统,这个系统需要整合气象数据、公共交通时刻表以及历史居住信息。我原以为书中会涉及到一些关于大规模地理空间数据的时间序列预测模型的优化技巧,例如如何有效处理因传感器故障导致的缺失数据,或者如何平衡模型预测的实时性和准确性之间的矛盾。然而,书中的代码示例和算法讲解,虽然逻辑清晰,但全部集中在处理生物序列比对和变异注释的特定需求上。这就像是一本顶级的汽车维修手册,它能教你如何精准拆卸和组装最新的航空发动机,但对于一个需要设计新型电动汽车电池管理系统的工程师来说,他需要的是关于电化学模型和热管理的知识,而不是关于活塞行程的细节。

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这本书的图表制作水平简直是教科书级别的典范,每一个流程图、每一个数据分布图都绘制得极为精细,配色考究,信息密度恰到好处。我最近在整理关于文艺复兴时期艺术品的市场估值模型的论文,急需一套科学的方法来处理那些受艺术史学家主观判断影响较大的定性数据,并尝试将其转化为可量化的指标。我期待书中能提供一些关于如何处理高维定性数据降维的成熟技术,或者至少是一些关于如何建立稳健的指标权重分配系统的案例。然而,书中展示的那些精美的图表,无一例外地都在展示基因组序列的变异热图或者蛋白质相互作用网络,这些图形的直观性和信息表达力是毋庸置疑的,但对我当前研究的“软科学”性质的数据处理来说,直接参考性非常有限。这本书在“如何展示复杂信息”方面无疑是满分,但在“展示什么复杂信息”这一点上,和我的需求有所错位。

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阅读这本书的过程,给我最大的感受是其内容的体系化和逻辑的严密性。作者的叙述方式非常清晰,从基础概念的铺陈到复杂算法的推导,环环相扣,几乎没有模糊地带。这让我想起我正在研究的古代哲学思想的演变逻辑,比如从先秦诸子百家到魏晋玄学的思想脉络梳理,那种需要小心翼翼界定术语、层层递进论证的过程。我原本设想,这本书或许会探讨信息熵在不同文明传播中的效率对比,或者如何构建一个描述不同文化间知识迁移速度的模型。但这本书似乎将所有精力都投入到了构建一个高效的、针对特定数据类型的分析框架上。这种专一性固然保证了专业深度,但对于我们这些更关注宏观理论构建和跨文化比较研究的人来说,可能需要自己做大量的“转译”工作,才能将其中蕴含的分析思想应用到我们自己的领域中去。

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