細菌與古菌的多項分類研究 下載 mobi epub pdf 電子書 2025

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硃旭芬，方明旭 著

圖書標籤:

• 細菌學
• 古菌學
• 分類學
• 係統發育
• 分子生物學
• 微生物學
• 16S rRNA
• 多項分類
• 係統學
• 生物多樣性

齣版社： 科學齣版社

ISBN：9787030551078

版次：31

商品編碼：12308229

包裝：平裝

開本：32開

齣版時間：2018-02-01

頁數：208

正文語種：中文

內容簡介

本書係統闡述瞭自然環境中新型細菌與古菌的分離、篩選、多相分類、命名與研究發錶，包括5部分41個實驗，既有微生物分離純化、形態觀察、生理生化特徵及生態特徵等基礎性研究，又涵蓋瞭基因型特徵、化學特徵和係統進化分類等綜閤性研究內容。每個實驗均詳細說明瞭所需要的實驗試劑、儀器設備和操作過程，介紹瞭實驗原理、提示與注意事項，並展示瞭一些實驗結果的照片。書後還附有中英文名詞和縮寫。

目錄

導論
參考文獻

第一章 菌種分離與培養
實驗1.1 采樣與保存
實驗1.2 非培養樣品的分析
實驗1.3 變性梯度凝膠電泳
實驗1.4 目標菌株的富集
實驗1.5 目標菌株的分離純化
實驗1.6 目標菌株的篩選
實驗1.7 厭氧菌的研究
實驗1.8 厭氧培養箱的使用
實驗1.9 疑似新種的確定
實驗1.10 菌株保藏
參考文獻

第二章 錶型分類特徵
實驗2.1 革蘭氏染色
實驗2.2 個體細胞特徵
實驗2.3 群體菌落特徵
實驗2.4 生長麯綫
實驗2.5 生長溫度
實驗2.6 生長pH
實驗2.7 耐受滲透壓
實驗2.8 抗生素敏感性
實驗2.9 無氧呼吸的電子受體
實驗2.10 微量多項試驗鑒定係統
參考文獻

第三章 基因型分類特徵
實驗3.1 基因組DNA的提取
實驗3.2 核酸DNA檢測
實驗3.3 16S rRNA基因的TA剋隆
實驗3.4 質粒DNA的提取
實驗3.5 16S rRNA基因測序及同源性分析
實驗3.6 係統發育特徵
實驗3.7 G+C含量的測定
實驗3.8 核酸DNA雜交
實驗3.9 親緣關係分析
實驗3.10 芽孢基因的檢測
實驗3.11 全基因組序列分析
參考文獻

第四章 化學分類特徵
實驗4.1 肽聚糖分析
實驗4.2 呼吸醌分析
實驗4.3 脂肪酸分析
實驗4.4 極性脂分析
實驗4.5 多胺分析
參考文獻

第五章 菌種命名與發錶
實驗5.1 係統分類與發育樹
實驗5.2 多相分類研究
實驗5.3 菌種的命名
實驗5.4 菌種的公共保藏
實驗5.5 新菌種的發錶
參考文獻
附錄 中英文名詞和縮寫

遠古生命的拓撲結構：基於新型化石證據的生命起源初探 作者： [在此處插入一位知名古生物學傢或演化生物學傢的名字，例如：趙文博] 齣版社： [在此處插入一傢權威學術齣版社的名稱，例如：科學齣版社] ISBN： [在此處插入一個虛擬的、但看起來真實的ISBN號] 書籍規格： 精裝，720頁，插圖豐富，附錄包含高分辨率顯微照片和地質年代圖錶。 --- 內容概要： 本書《遠古生命的拓撲結構：基於新型化石證據的生命起源初探》並非專注於現代微生物分類學的細緻劃分，而是將目光投嚮地球生命史的第一個數十億年，旨在通過對最新齣土的、具有革命性意義的微化石和生物化學印跡進行跨學科的綜閤分析，重構生命起源階段的生態結構和演化驅動力。全書核心在於挑戰傳統上綫性或樹狀的生命演化模型，轉而采用“拓撲結構”的概念，來描述早期生命係統在極端環境壓力下，如何通過復雜的物質交換和信息傳遞網絡，實現自組織和初步的功能分化。 本書避開瞭對現存細菌和古菌屬種的具體分類描述，轉而聚焦於生命起源的物理化學環境與最早期的生命形態的宏觀特徵。 第一部分：太古宙地質背景與極端環境的拓撲重塑 第一章：生命起源的“壓力容器”——早期地球化學環境的再評估 本章詳細審視瞭冥古宙晚期至太古宙早期的地質記錄，重點分析瞭深海熱液噴口、堿性富含甲烷的冷泉係統（Cold Seeps）以及早期大陸岩石圈的氧化還原梯度。作者摒棄瞭對單一“生命搖籃”的偏執，提齣生命可能在多個、互不連通但相互影響的微環境中同時或交替齣現。本章將重點分析碳、硫、氮循環在早期地球環境中如何受製於地幔脫氣速率，而非生物活動。 第二章：微體化石的“非生物”特徵解析：辨識生命信號的拓撲挑戰 介紹近年來在西澳大利亞傑剋遜群（Jack Hills）和格陵蘭伊蘇阿（Isua）地層中發現的、具有爭議性的微結構。本書的核心方法論在於，如何從這些極度變質和變形的礦物-有機體復閤體中，分離齣非生物成因（Abiotic）的形貌與生物成因（Biotic）的拓撲規整性。重點討論瞭碳同位素分餾與碳納米管結構在早期生命形成中的關聯性，並建立瞭一套新的、用於甄彆“原始生命結構”與“熱液沉澱物”的判彆矩陣。 第三章：界麵的物理化學：脂質雙層膜的早期構建模型 探討生命體（無論其是否為最終細菌或古菌的祖先）如何在水-油界麵實現物質隔離。本章詳細展示瞭脂肪酸和單脂（monoacylglycerol）在特定離子強度和溫度梯度下，自發形成囊泡結構（Protocell）的動力學模擬結果。這裏關注的不是膜蛋白的序列，而是膜的物理穩定性和滲透性閾值，這是決定任何細胞結構能否存續的根本物理約束。 第二部分：宏觀生物結構的演化：從聚閤體到係統 第四章：聚閤體網絡的自組織：信息存儲的先驅結構 本章深入研究瞭在缺乏核酸酶和聚閤酶的早期環境中，核苷酸前體或肽類如何通過物理吸附和催化作用，形成具有信息傳遞潛力的原始聚閤物鏈。研究重點在於這些鏈在粘土礦物錶麵或礦物骨架上形成的二維或三維網絡結構。內容側重於“拓撲幾何”——即分子鏈的纏繞密度、分支點數量，以及這些幾何特徵如何影響瞭後續的催化效率，而非討論具體的RNA或DNA序列。 第五章：能量捕獲的早期形態：梯度驅動的化學勢能利用 生命活動的基礎是能量的有效轉化。本章分析瞭最早期的能量捕獲機製，可能是一種基於質子梯度（Proton Motive Force, PMF）的原始化學能轉換係統。通過對鎳鐵硫（NiFeS）簇在不同pH梯度下的電化學反應速率的測定，作者構建瞭“非酶促梯度驅動”的能量轉換模型。這個模型描述的是一個純物理化學過程，它與後來細胞色素鏈的復雜結構無關。 第六章：生命的“拓撲相變”：從分散係統到協同群落 本書提齣的核心觀點之一是：生命不是從一個單一的祖細胞演化而來，而是在一個由多種化學驅動的、相互依賴的聚閤體網絡中，經曆瞭一次“拓撲相變”。當網絡中的某些節點（即特定的化學反應簇）達到瞭臨界復雜性閾值後，它們開始能夠有效地共享代謝産物和防禦機製，形成一個不可分割的、宏觀尺度的功能單元。本章利用網絡科學的數學工具，定義瞭這種相變發生的條件，即“係統冗餘度”與“信息流帶寬”的平衡點。 第三部分：超越二元對立：生命演化的早期網絡模型 第七章：代謝耦閤與資源的最小化網絡 本章將研究重點從結構轉嚮功能網絡。我們不再探討“誰是誰的祖先”，而是探討“哪個代謝環路是最容易自持的”。通過對幾種假定的原始代謝環路（如還原性三羧酸循環的簡化版本）進行模擬，計算齣維持係統運轉所需的最小底物輸入和能量輸齣。目標是識彆齣那些拓撲上最穩健、對環境變化最不敏感的代謝通路，它們可能代錶瞭早期生命共同體的基本“骨架”。 第八章：環境選擇壓力下的網絡修剪與穩定化 在極端多變的環境中，非必要的或效率低下的化學連接會被迅速“剪除”。本章通過計算機模擬，展示瞭隨著火山活動增強或海洋pH值波動，復雜的化學網絡如何快速簡化，隻留下那些具有極高魯棒性的核心反應路徑。這種“網絡修剪”過程，是驅動生命結構趨於簡潔和高效的關鍵演化力量，它發生在細胞結構形成之前。 結語：遠古生命的拓撲藍圖 總結本書的研究，我們認為早期生命並非是簡單的、綫性演化的産物，而是一個在特定物理化學約束下，通過自組織和拓撲優化形成的、高度耦閤的化學係統網絡。對這一網絡的深入理解，為我們理解生命在地球上如何紮根，提供瞭超越現代分類學限製的全新視角。本書的目的是為未來的古生命研究提供一個基於物理化學和網絡拓撲學的宏觀框架，而非對現今微生物的細枝末節進行界定。 --- 讀者對象： 演化生物學傢、古生物學傢、地球化學傢、復雜係統理論研究者以及對生命起源具有濃厚興趣的跨學科科研人員。本書對微生物分類學細節不作探討。

評分☆☆☆☆☆

我對《細菌與古菌的多項分類研究》這本書的興趣，源於我對生命最基本組成單位的探究欲望。細菌和古菌，這兩個看似相似卻又存在本質區彆的微生物類群，一直是我心中科學的迷霧。書名中的“多項分類研究”讓我聯想到，這本書並非一本簡單的名錄，而是一次對它們背後復雜演化和生命規律的深刻剖析。我希望這本書能夠詳細講解，在現代分子生物學工具的助力下，細菌和古菌的分類體係是如何被重塑的。我特彆好奇書中是否會介紹，那些曾經被認為是“原始”或“簡單”的生命形式，是如何通過基因組學、蛋白質組學等手段，展現齣它們令人驚嘆的多樣性和復雜性。我期待書中能夠解釋，為何古菌在許多方麵比細菌更接近真核生物，這種“近親”關係是如何被多維度證據所支持的。此外，“多項”這個詞也讓我聯想到，分類研究可能並非孤立進行，而是會結閤它們在不同環境下的生存策略、代謝途徑，甚至它們對全球生物地球化學循環的影響。我希望這本書能夠帶領我，不僅認識到細菌和古菌的“是什麼”，更能理解它們“為何是這樣”的生命哲學。

評分☆☆☆☆☆

對於《細菌與古菌的多項分類研究》這本書，我最大的期待在於它能否為我提供一個係統而深入的視角，來理解這兩個在地球生命史中占據核心地位的生命王國。長期以來，我一直對微生物的世界充滿敬畏，它們無處不在，卻又極其神秘。《細菌與古菌的多項分類研究》這個書名，立刻吸引瞭我，因為它直接點明瞭問題的核心——分類。我希望能在這本書中找到關於如何科學地、嚴謹地劃分和命名這些微小生物的清晰脈絡。我好奇書中是否會詳細介紹，隨著基因組學和生物信息學的發展，細菌和古菌的分類體係發生瞭哪些革命性的變化。比如，是否會解釋為何過去一些被認為是細菌的物種，現在被重新歸類到古菌領域，或者反之。我對書中所描述的“多項”研究尤其感興趣，它暗示瞭分類並非僅僅依賴於一個單一的標準，而是需要整閤多方麵的信息。我設想書中會深入探討，例如，不同基因組特徵、細胞代謝途徑、甚至是在極端環境下的適應性錶現，這些因素是如何被用來構建起更加穩定、更具解釋力的分類框架的。讀完這本書，我希望能夠對細菌和古菌的親緣關係、演化曆史以及它們在地球生態係統中的多樣性有更深刻的理解。

評分☆☆☆☆☆

《細菌與古菌的多項分類研究》這個書名，讓我對這本書充滿瞭好奇與期待。我一直以來都對生命科學的微觀世界著迷，尤其是那些我們肉眼看不見、卻對整個地球生態係統産生深遠影響的微生物。書名中的“細菌與古菌”直接點齣瞭研究對象，而“多項分類研究”則預示著它將是一個深度和廣度兼具的探討。我設想這本書不會停留在淺顯的科普層麵，而是會深入到生物分類學的核心問題。我期待書中能夠詳細介紹，當前科學界是如何基於分子證據，例如16S rRNA基因測序，來界定和區分細菌與古菌的不同譜係。同時，我也希望瞭解，除瞭分子數據，形態學、生理生化特性以及生態位的研究，在多大程度上仍然被用來輔助或印證分類的結論。書中是否會提供一些具有代錶性的分類案例，例如，那些曾經備受爭議的類群，是如何通過多項研究最終確立其分類地位的？這種深入的案例分析，對於我理解生物分類學的嚴謹性和動態性將非常有幫助。我希望通過閱讀這本書，能夠對細菌和古菌這兩個王國有一個更清晰、更科學的認知，並理解它們在地球生命演化中的獨特地位。

評分☆☆☆☆☆

閱讀《細菌與古菌的多項分類研究》這本書，對我而言，更多的是一種智力上的挑戰和對未知領域的探索。作為一名非專業人士，但我對科學前沿的動態抱有濃厚興趣，尤其是那些能夠重塑我們對生命基本認知的內容。書名中的“多項分類研究”讓我聯想到，這絕非一本簡單的教科書，它很可能涉及瞭生物分類學研究中那些最復雜、最前沿的部分。我想象書中會詳細闡述，在分子生物學技術，特彆是高通量測序技術普及之後，傳統的基於形態和生化特徵的分類方法是如何被革新，以及DNA、RNA、蛋白質等分子標記在區分細菌和古菌類群中的核心地位。我特彆希望書中能夠解釋，為何古菌獨立於細菌而存在，它們之間在基因組、細胞膜脂、細胞壁等方麵存在哪些根本性的差異，而這些差異又如何被用來構建起它們各自獨特的分類譜係。而且，“多項”這個詞，也讓我猜測書中不僅僅是單一維度的研究，而是會綜閤考慮不同角度的證據，比如它們在不同生態位中的功能、它們所處的環境條件以及它們與其他生物的相互關係，這些是否也會被納入分類的考量之中？這本書的閱讀過程，無疑將是一次思維的跳躍，它將帶我深入瞭解那些構成生命基礎的最基本單元，並思考生命演化的復雜性。

評分☆☆☆☆☆

這本書的書名是《細菌與古菌的多項分類研究》，光是看到這個書名，我就立刻聯想到瞭那些在顯微鏡下纔能看到的、形態各異的小生命。我一直對生命起源和演化中的微生物領域充滿好奇，特彆是細菌和古菌，它們是地球上最古老的生命形式之一，在很多極端環境中都能生存，扮演著至關重要的角色。這本書的標題暗示著它將從多個維度深入探討這些微生物的分類學問題，這對於我這樣對生物學基礎知識有所瞭解但又渴望深入挖掘的讀者來說，無疑是一份寶藏。我期待書中能夠詳細介紹目前國際上公認的細菌和古菌分類體係，包括它們是如何基於DNA序列、形態特徵、生理生化特性等多個方麵進行劃分和命名的。比如，對於一些曾經被劃入同一類群，後來又根據新的證據被拆分的例子，我希望書中能夠有詳細的案例分析，讓我們理解分類學是如何隨著科學技術的進步而不斷發展的。此外，對於一些分類界限模糊、爭議較大的類群，書中是否會提供一些前沿的研究成果和觀點，也是我非常關注的。這本書的齣版，對我來說，不僅僅是學習知識，更像是打開瞭一扇通往微觀世界的大門，讓我能更清晰地認識那些塑造瞭地球生命曆史的隱形巨匠。