内容简介
生命是地质历史过程的产物,走过了30多亿年的演化征程。大自然创造出数以千万计的物种,之后又将其销毁,终而复始,生生不息。对进化这样涉及数以千万计的物种、覆盖整个地球表面以及跨越数十亿年的历史过程来说,即便汇集全人类的所有经验,也不过是沧海之粟。何谓生命?何谓物种?何谓进化?何谓变异?物种如何进化?物种为何进化……这些似乎易于感知或想象,却十分难以准确作答。
人类对进化的认知与其自身的生物学演化一样,都是历史的产物,从古代的哲学猜想延续到现代的科学论证。关于进化,可谓众说纷纭,但每一种学说都只映射了一个或少数侧面。《进化理论之审读与重塑》旨在构建一种多维的进化视角,对达尔文主义、拉马克主义、孟德尔遗传学、群体遗传学、表观遗传学、中性进化论、直生论、古生物学、生态学、行为学、发育生物学以及哲学等进行了跨越范式的整合,并借助希腊古贤关于事物存在的哲学范式,提出了进化“四因说”。从本质上来说,有机体也是质料、形式、动因和目的的统一,进化是种族承载于无数个体的一种生命运动,是多层次运动的复合,承受遗传·生理·生态等诸多动因的联合驱动。
进化论,从古希腊哲学家亚里士多德的“存在巨链”扬帆启航,搭载19世纪的拉马克和达尔文学说,在20世纪“现代综合”的喧闹声中,又重新驶回了亚氏的理性港湾一一“四因说”,这在表象上看似回归,而在本质上却是重塑!
《进化理论之审读与重塑》绝非进化理论及其历史的简单罗列,而是批判性地审读与革新式的重构。《进化理论之审读与重塑》兼顾专业性和科普性,可供进化生物学、基础生物学、分子生物学、发育生物学、古生物学、生物地理学、动物生理学、动植物分类学、生态学、生物哲学、微生物学、生命科学史、系统科学、环境科学等领域的科研人员、师生及感兴趣的社会公众参考。
内页插图
目录
前言
第一章 定义——生命、物种和进化
一、何谓“生命”?
二、何谓“物种”?
三、何谓“进化”?
四、直线进化与分支进化
五、进化的证据
六、进化依然留下许多未解之谜
第二章 古代哲学家的朴素生命进化观
一、阿那克西曼德——人是从鱼而来
二、恩培多克勒——“适者生存,自然选择”思想的萌芽
三、亚里士多德——“存在之链”与生存斗争
四、列子——类无贵贱
五、庄子——万物皆种也,以不同形相禅
第三章 启蒙运动时期——不变与进化之激烈交锋
一、生物学家施旺麦丹——万物同源,但第一种动物由上帝创造
二、外交官和旅行家马耶——物种总在变化,新获得的性状可以遗传
三、分类学家林奈——上帝创造基本结构,自然通过杂交填补上帝计划中细节上的空缺
四、博物学家布丰——生物因环境变化而变异,并遗传给后代,因此物种可变
五、哲学家狄德罗——如果生命是偶然的,那就没有理由保持不变
六、博物学家邦尼特——造物主塑造了存在之链上的种源序列
七、博物学家罗宾奈——存在之链上只有连续的个体,而没有物种
八、哲学家霍尔巴赫——自然规律支配着一切物质的运动和结构,人类也是自然的产物
九、哲学家康德——自然界由没有计划的机械力产生出从粗糙的物质到人的存在之链
十、诗人歌德——生物同宗说
十一、医生伊拉斯谟——上帝设计的生物可自我完善,通过获得性遗传发展出新器官
第四章 纷杂的前奏——从拉马克到华莱士
一、博物学家拉马克——动态化的存在之链,直线性的种系进化
二、解剖学与古生物学家居维叶——器官相关法则,按结构的分类动摇了存在之链
三、动物学和胚胎学家塞因特一希莱尔——通过原型分化对(趋异)类型进行统一
四、哲学家黑格尔——沿着存在之链进化与流射的统一
五、园艺学家马修——没有先前生物的模型或胚种,也可能产生新类型
六、发育生物学家冯·贝尔——胚胎发育中留存的演化痕迹
七、赖尔——均变论,将连续性引入到创世过程中
八、地质学家布赫——环境变化驱动新种从较旧的形态中形成
九、业余博物学家钱伯斯——生命通过上帝赋予的冲动和对环境的适应性向人类线性发展
十、博物学家奥肯——复杂有机体是纤毛虫的聚合体,结构可缓慢改变
十一、动物学和古生物学家欧文——区分“同功”与“同源”结构
十二、植物学家和古生物学家翁格尔——所有植物从某个早期植物(通过植物的内部变化)演变而来
十三、博物学家华莱士——自然选择理论的共同发现者
第五章 进化论的圣歌——逢迎伟大的达尔文
一、达尔文进化论的核心——个体变异、生存斗争与自然选择
二、新物种如何得以形成?
三、大灭绝——旧类型被新类型排挤的结果
四、共同祖先理论
五、近亲交配导致衰退
六、从不同视角对达尔文进化论的透视
第六章 达尔文之后的进化论
一、海克尔——“生物发生律”
二、直生论——进化的趋势是线性的,但是非适应性的
三、德弗里斯——生物进化的“突变论”
四、一些哲学家的进化观
五、新达尔文主义和综合进化论
六、“中心法则”真的是否定获得性遗传的利器吗?
……
第七章 对达尔文的物种形成观之解读
第八章 对达尔文进化论之诘难
第九章 变异从何而来?
第十章 谁选择?为何选择?选择什么?
第十一章 做什么井观什么天
第十二章 浅尝辄止——谁是谁非?
第十三章 自然选择——有无方向?
第十四章 物种——缘何如此纷繁?
第十五章 划时代的生命三域说——真理or谎言?
第十六章 拉马克主义之还魂——后天是先天的延绵与超越
第十七章 白云苍狗——“积木”搭建起生命世界
第十八章 进化之“四因说”
附Ⅰ 揭开遗传密码子的起源之谜——ATP中心假说
附Ⅱ 揭开细胞核和“性”的起源之谜
漫笔
主要参考文献
前言/序言
宇宙中并无永恒,一切都摇曳于过程的链条之中,生命更是如此——没有生灵不是凡尘中的匆匆过客,无论个体,还是种族。生命是地质历史过程的产物,走过了30多亿年的演化(进化)征程——从混沌到秩序,从简单到复杂,从共性到个性……物质世界因此而获得了学习、适应、组织、竞争、创造的神奇力量。大自然将奥秘或法则隐匿于密码之中,借此创造出数以千万计的物种,之后又将其销毁,终而复始,生生不息。但是,何谓生命?何谓物种?何谓进化?何谓变异?物种如何进化?物种为何进化……这些似乎易于感知或想象,却十分难以准确作答。
巴顿等(2010)指出,“对于发生过的历史的追溯以及探讨历史为什么会这样,比起对现存机制的解释更为困难。实际上,许多这类问题也许是无法回答的……科学家常常提出可能但不能验证的说法来解释为什么这种或那种特征进化”。Rolston(2003)认为,“趋势是历史解释所必需,却绝不能直接观察到,也难以在有限的时间间隔或观察范围内检测出来”。但是,困难并未能阻挡人类对进化奥秘的探寻(因为这关乎人类自身从何而来),从古希腊一直延绵至今,而我也是这沧海一粟。在达尔文点燃熊熊圣火之后,进化论是否已从璀璨绚丽步入日暮黄昏?
《万物归一:跨学科视野下的复杂系统动力学》 内容简介 本书是一部深度探索复杂系统动力学及其在多元科学领域中应用的学术专著。全书以宏大的跨学科视野,系统梳理了复杂系统的基本概念、核心理论模型以及在物理、生物、社会、信息科学等前沿领域的前沿进展。其核心目标在于揭示隐藏在看似无序表象下的统一性规律,并为理解和预测多尺度、非线性互动现象提供严谨的理论框架和分析工具。 第一部分:复杂系统理论的基石与方法论 本部分聚焦于复杂系统科学的理论基础构建。我们首先界定“复杂性”的内涵,区分其与“随机性”和“混乱”的本质区别,强调系统内在的结构性、涌现性与适应性是复杂性的关键特征。 第一章:复杂性的拓扑学与信息论基础 本章深入解析了描述复杂系统状态空间的方法论。我们将引入非线性动力学中的关键工具,如庞加莱截面、李雅普诺夫指数,用以量化系统的敏感依赖性和混沌特性。同时,借鉴信息论的视角,讨论系统的自组织程度与信息熵的关系,特别是针对复杂网络结构中的信息流转效率和鲁棒性进行量化评估。我们将详细探讨有效复杂性(Effective Complexity)的概念,它超越了简单的熵值度量,强调系统信息结构的组织性和功能性。 第二章:自组织临界性与幂律分布的物理基础 本章聚焦于复杂系统在演化过程中普遍展现的自组织临界性(Self-Organized Criticality, SOC)现象。通过沙堆模型(Sandpile Model)的深入分析,阐释了系统如何通过持续的、非平衡的能量输入,自发地趋向于一个临界状态,从而产生具有幂律分布的事件级联。这一章将探讨SOC在不同物理系统,如磁性材料的畴壁运动和地质断层的能量释放中的普适性。我们力图构建一个从微观交互规则到宏观幂律统计特征的严密推导链条。 第三章:涌现现象的数学建模与涌现动力学 涌现(Emergence)是复杂系统的标志性特征,指宏观层面的集体行为不能简单地由个体行为线性叠加得出。本章致力于构建描述涌现动力学的数学框架。我们将探讨元胞自动机(Cellular Automata)在模拟群体行为中的优势与局限,并详细阐述基于基于主体的建模(Agent-Based Modeling, ABM)方法论,如何通过精细化个体规则来复现高度组织化的宏观模式。特别关注耦合振子模型(Coupled Oscillator Systems)中同步(Synchronization)现象的相变机制。 第二部分:跨越边界的复杂系统应用前沿 在奠定理论基础后,本书的第二部分将视角转向复杂系统动力学在具体科学领域中的应用与前沿探索。 第四章:生物系统中的网络拓扑与鲁棒性 生命系统的核心特征之一便是其高度模块化和韧性的网络结构。本章分析了代谢网络、蛋白质相互作用网络(PPI)以及神经元网络的拓扑特征,如小世界效应(Small-World)和无标度特性(Scale-Free)。重点讨论这些拓扑结构如何赋予生物系统抵抗随机扰动和蓄意攻击的鲁棒性。此外,我们将深入探讨基因调控网络中的反馈回路如何产生振荡行为和记忆效应,以及这些动力学机制如何在发育生物学中实现形态发生。 第五章:金融市场与社会系统中的非线性反馈 经济和金融市场被视为典型的非线性、高度耦合的复杂系统。本章利用统计物理学的工具来分析市场波动性。我们摒弃了传统的有效市场假说(EMH),转而采用基于异质性个体(Heterogeneous Agents)的模型,模拟交易者情绪、信息扩散和羊群效应如何导致市场泡沫与崩溃。在社会科学方面,本章将复杂系统动力学应用于分析舆论极化、信息茧房的形成机制,以及社会规范的扩散与演变过程,强调了意见动力学(Opinion Dynamics)模型在理解集体决策中的关键作用。 第六章:人工智能与计算复杂性 本章探讨复杂系统理论如何指导下一代人工智能的设计。我们将从信息物理系统的角度审视深度学习网络的内部结构,分析其层级组织如何形成有效的特征表征。核心讨论包括:可解释性人工智能(XAI)与系统透明度的关系,以及如何利用复杂性度量来评估模型学习的深度和泛化能力。此外,我们将引入计算不可约性(Computational Irreducibility)的概念,论证某些高度复杂的计算过程(如通用人工智能的某些方面)可能无法通过简化模型进行有效预测,只能通过模拟其自身的演化过程来理解。 第三部分:前瞻与整合 第七章:非平衡态热力学与信息驱动的演化 本章将复杂系统置于更广阔的非平衡态热力学框架下考察。我们探讨昂萨格倒易关系(Onsager Reciprocity)在远离平衡态的系统中失效后的替代描述。重点分析耗散结构(Dissipative Structures)的形成条件,以及系统如何通过有效耗散能量来维持其高度有序的、远离热力学平衡的稳态。信息处理本身被视为一种耗散过程,本章将论证信息流如何驱动系统的结构性演化,指向一种信息驱动的宏观物理学。 第八章:复杂系统科学的未来挑战与统一展望 总结全书,本章着眼于该学科未来的研究方向。我们讨论了如何整合量子信息与经典复杂系统动力学的可能性,特别是在量子计算对传统计算复杂度的挑战背景下。最后,本书倡导构建一个更具预测性的“复杂性科学”统一框架,旨在超越学科壁垒,为理解宇宙中的涌现秩序提供一个普适的、数学上自洽的理论语言。 本书特点: 跨学科深度融合: 理论推导与生物学、经济学、社会学案例紧密结合,避免了单一学科的局限性。 方法论严谨: 重点介绍和应用了最新的数值模拟技术(如GPU加速的ABM)和高维数据分析工具。 概念清晰: 复杂系统中的核心术语(如涌现、反馈、临界性)均给出严格的数学或物理定义,并辅以清晰的图示和模型解释。 本书适合于物理学、计算机科学、系统生物学、复杂性科学的本科高年级学生、研究生以及致力于跨学科研究的科研人员阅读。